deepTools 是一套基于python开发的工具,适用于有效处理分析高通量测序数据,可用于ChIP-seq, RNA-seq 或 MNase-seq。 #1. deepT...
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ATAC-seq信息分析流程主要分为以下几个部分:数据质控、序列比对、峰检测、motif分析、峰注释、富集分析,下面将对各部分内容进行展开讲解。 一、测序数据过滤与质量评估 ...
假装是前言 学了很久的R,一直也没啥进展,之前一直觉得R不是很容易的东西吗,复制粘贴代码就好了。。emmm,太年轻太年轻。。 我用R的日常就是画热图,各种各样的热图。所以网上...
前言 这次给大家带来的是16年发表在NATURE PROTOCOLS上面的一篇处理RNA-seq数据的文章:Transcript-level expression analy...
今年是我和她相识的第十年,相恋的第七年,结婚,的第三年。十年前,执我一半去寻另一半。七年前,我不知道她将以怎样的形式丰饶我的心田。三年前,我以为已经接纳了她的咸咸甜甜。可是,...
10xGenomics单细胞转录组 10xGenomics单细胞转录组分析的核心就是聚类,但是单细胞转录组分析的聚类到目前为止还存在很多困难和挑战,具体可以参考文献Chall...
拟时(pseudotime)分析,又称细胞轨迹(cell trajectory)分析,通过拟时分析可以推断出发育过程细胞的分化轨迹或细胞亚型的演化过程,在发育相关研究中使用频...
SCENIC:Single Cell rEgulatory Network Inference and Clustering 目前支持分析的物种:人、鼠、果蝇 input的要...
Markdown是一种纯文本格式的标记语言。通过简单的标记语法,它可以使普通文本内容具有一定的格式。 相比WYSIWYG编辑器 优点:1、因为是纯文本,所以只要支持Markd...