生信技能树，生信菜鸟团，jimmy
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关于人类参考基因组的一些认识1. 如何选择参考基因组？——李恒2017年年底博客 1.1 三种选择 如果比对到GRCh37/hg19，使用： ftp://ftp-trace.ncbi.nih.gov/1...
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2020-05-12扩充enhancer的定义
enhancer的数据库信息 http://www.360doc.com/content/19/0218/15/52645714_815769221.shtmlhttps:/...
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转录组入门（7）：差异表达分析这个步骤推荐在R里面做，载入表达矩阵，然后设置好分组信息，统一用DEseq2进行差异分析，当然也可以走走edgeR或者limma的voom流程。基本任务是得到差异分析结果，进...
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MSKCC Research Associate<br>别赶不上野心，又辜负了努力
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RNA-seq的比对tutorial2020.3.17#鉴于liftover转坐标不给力，我用了ncbi的Remap，使用方面看这篇参考https://www.jianshu.com/p/41e5280f59c...
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下载SRR文件的aspera和prefetch方法参考用list批量下载SRR数据的方法 https://www.jianshu.com/p/f16ed4c79739 1.aspera安装aspera后 ebi可以直接下载f...
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StringTie在注释基因组时的注意事项
在利用RNA-seq注释基因组时，有一个问题就是，我将不同组织来源的转录组数据和参考基因组比对之后，那下一步是1）先将这三个比对结果进行合并，然后用StringTie进行预测...
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