1. 如何选择参考基因组?——李恒2017年年底博客 1.1 三种选择 如果比对到GRCh37/hg19,使用: ftp://ftp-trace.ncbi.nih.gov/1...
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这个步骤推荐在R里面做,载入表达矩阵,然后设置好分组信息,统一用DEseq2进行差异分析,当然也可以走走edgeR或者limma的voom流程。基本任务是得到差异分析结果,进...
在利用RNA-seq注释基因组时,有一个问题就是,我将不同组织来源的转录组数据和参考基因组比对之后,那下一步是1)先将这三个比对结果进行合并,然后用StringTie进行预测...