许多基因组的文章里都会提到使用PAML进行基因的正选择分析(positive selection), 网上也有一些教程介绍如何用PAML进行分析。无论是文章，还是教程，大多只...
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计算分子进化-搞懂PAML的正选择分析 -
比较基因组学常用分析软件和分析方法
转载自https://blog.csdn.net/qq_36608036/article/details/109466468[https://blog.csdn.net/qq...
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K-mer分析独立实验 将某随机试验重复N次，若各次试验结果互不影响，即每次试验结果出现的概率都不依耐于其他各次试验的结果，则称这N次试验是独立的。 贝努利试验（Bernoulli tri...
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那令人困惑的比对工具选择啊~
写在前面的废话 我可能不适合做科研，因为我总是对一些“没有必要”的事斤斤计较~ 刚开始接触二代测序时，是跟着Jimmy大神从RNA-seq开始入门的。那时候使用的比对工具是H...
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Blastdbcmd,makeblastdb,blastn.使用简介
blastdbcmd,makeblastdb,blastn.使用简介 运行平台是 ubuntu 17.04 1 blastdbcmd 作用: Retrieves sequen...
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全基因组复制 WGD |（一）简介
01 什么是全基因组复制 多倍化（polyploidy）或全基因加倍/复制（whole genome duplication, WGD）事件是指基因组内的所有序列都发生重复，...
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入门流程 | 三代测序基因组从[ 组装 ]到[ 评估 ]- Pacbio、Flye、Quast写在前面 最近，带一个师妹了解并做了简单的基因组组装工作，感觉其上手速度还可以。慢慢地有初窥生物信息学数据分析门径的样式，于是....还是鼓励她整理整理流程，分享分享（其实....
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hifiasm对HiFi PacBio进行组装hifiasm是一个能有效利用PacBio HiFi测序技术，在分型组装图(pahsed assembly gprah)中可靠的表示单倍体信息的算法。 流程介绍 hifias...
