对于我这种拖延癌晚期患者来说，如何提高执行力一直是非常痛苦的事情。这篇回答[https://www.zhihu.com/question/19979300/answer/12...
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如何提高执行力
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方法论写的很有启发性，但是这些方法论背后的本质需求是什么？目的、预算、原则、四象限、候选清单与大局观的内在联系是什么？存量思维是如何影响判断的？更疑惑了
当我们讲大局观，我们在讲什么？
围棋对弈的时候，人们会讲到大局观。不在意一城一池的得失，对全局的把握，对大势的判断，对节奏的掌控，能从整局棋的输赢来考虑布局和落子的人是有大局观的人。 而在我们这个时代，最稀...
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Docker Desktop 使用笔记
我之前没有接触过Docker，尝试源代码编译一个在线自动化服务n8n[https://n8n.io/]时总是出错，硬着头皮用 docker 安装了，发现 Docker 还挺方...
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R ...(dots) 参数使用方式
介绍 当你不确定一个函数有多少个参数输入时，可以使用...参数占位。例如R的打印函数?print： help文档点出了使用方式：传递给其他方法或从其他方法传递，意思就是说有多...
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重建在线阅读流程
诉求 受在线阅读处理流程：从需求、到方法、再到工具[https://sspai.com/post/36795?utm_source=pocket_reader]（强烈建议先读...
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absolute的文档说明是真垃圾啊
解析ABSOLUTE软件
简介ABSOLUTE ABSOLUTE是Broad研究所开发的一款癌症CNV分析软件，实质是一个R包，可以定量细胞的绝对拷贝数、肿瘤纯度与倍性，如果提供突变数据，还能探究克隆...
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配置 VSCODE 写 R 代码
使用 VSCODE 写代码还是很爽的，因为有非常充裕的插件，多种语言的支持，并解决了我远程写代码无法同时看到输出的痛点。这篇文章记录了我配置 VSCODE 的步骤以及遇到的问...
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@ZYXNB 不用客气，现在看来很多地方没有写好，有兴趣的话直接看原作收获更大，祝进步。
31.《Bioinformatics-Data-Skills》之Unix sort命令
对数据进行排序的好处有： 提高特定程序的运行速度，这些程序（后续会介绍）在输入排序过的数据会大大减少运行时间 sort | uniq 作为一个常用的连招使用保留唯一值（下一节...
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笑是生活的解药？不，笑是生活的麻药
笑是生活的解药。 笑是我们社会大众倡导的，笑是生活的解药，笑一笑十年少，也有很多类似的谚语这样诠释它。但是最近人间清醒-呼兰这次叫起真了。 呼兰，脱口秀演员，毕业于美国的哥伦...
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根据PMID号批量下载文献
该方法基于Python3.7实现，需要安装以下包： 新建文件夹作为工作空间，下载工程（无git的话去官网[https://github.com/billgreenwald/P...
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二代测序文库构建-概述与挑战（1）高通量测序又称NGS，重新定义了基因组学研究。近年来，NGS技术稳步发展，伴随着成本下降以及测序应用呈指数增加。本文，我们研究了影响测序文库质量的关键因素，以及，在DNA来源...
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@Jason_5b5a 简书无法发送图片，私信已回复，仍有问题截图发送到我的邮箱吧：pseudoway@163.com
67.《Bioinformatics Data Skills》之pileup文件与突变识别
pileup文件是指通过BAM文件每个位置重叠的read对比对结果进行的总结，可用于判断各个位点突变的可能性。这里通过命令行工具演示使用pileup文件进行突变识别（仅供参考...
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82.《Bioinformatics Data Skills》之SQLite 函数
上节我们采用SELECT直接进行列信息提取，实际上可以在提取的同时创建与命名新的列。 以一个例子说明： 其中第一句将trait列转为小写并命名为相同的名字trait；第二列通...
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81.《Bioinformatics Data Skills》之SQLite SELECT 操作
SQL数据库的SELECT操作将是你学过的最为有用的数据操作技术之一。除了关系数据库，你能够在广泛的工具中找到它的影子。不同数据库管理系统的语言相当一致，你可以将这项技术应用...
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如何查找投稿杂志？
个人经验，可以采用如下的两种方式查找杂志： 1. 杂志搜集： 关键词法根据自己的研究方向拟定一些关键词，使用PubMed[https://pubmed.ncbi.nlm.ni...
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80.《Bioinformatics Data Skills》之SQLite关系数据库
简介 数据库是解决内存不足的另一方案，关系数据库存储一系列的表格，通过多个表格间的关系来提取与合并特定的信息。目前常用的关系数据库是采用SQL语句，例如MySQL，Postg...
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79.《Bioinformatics Data Skills》之使用bgzip与tabix解决内存不足问题
某些基因组文件（包括GFF，BED与VCF类型）特别大，无法读入到内存。然而需要随机地读取某些区域的信息的话，不读入内存进行处理又特别费时。借助bgzip与tabix命令可以...
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@大叔的生信备忘录 linux的限制很少，我试过是可以同名的。这个例子是局限了，事实上如果使用模糊匹配的话这样操作更有必要
76.《Bioinformatics Data Skills》之shell find命令
前面我们提到pipeline处理多个文件有两种方式，一种是先读取存储数据信息的配置文件，另一种是直接通过一定的条件选取数据。通过find命令可以帮助我们灵活的查找相关文件，下...
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78.《Bioinformatics Data Skills》之Make实现pipeline
如果你经常在Linux系统安装软件的话，对Make工具一定不会陌生，它会执行一个makefile脚本，通过一个非常复杂的过程来确保所有依赖满足条件。我们也可以编写makefi...