先使用bowtie2软件自带的测试数据生成sam/bam文件,代码如下: 1.统计共多少条reads(pair-end reads这里算一条)参与了比对参考基因组 2.统计共...
这个是有机结合生物信息学的linux和数据格式的练习题: 下载bowtie2软件后拿到示例数据: 1.统计reads_1.fq 文件中共有多少条序列信息 2.输出所有的rea...
sed 是一种流编辑器,它一次处理一行内容。 处理时,把当前处理的行存储在称为“模式空间”(pattern space)的临时缓冲区中,接着用 sed 命令处理缓冲区中的内容...
1.在任意文件夹下面创建形如 1/2/3/4/5/6/7/8/9 格式的文件夹系列。 2.在创建好的文件夹下面,比如我是/Users/jimmy/tmp/1/2/3/4/5/...
2019.08.22 今天学习了r语言关于GEO数据挖掘方面的知识点,做一些整理。 1.首先是相应数据的下载与检查 利用R包进行下载 2.构建矩阵,数据处理(DEG) 3.进...