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GWAS大家都很熟悉了,随着目前越来越多的重测序文章的发表,可见如今SNP数据是非常的丰富,以及GWAS也发展了15年了,如今到了一个后GWAS时代。GWAS我也做了很多了,...
转自:https://www.jianshu.com/p/fd2b417ceff8[https://www.jianshu.com/p/fd2b417ceff8] 基因组中重...
本篇为转载,原创作者为AI写代码的DNA 义冠转座元件对基因调控的作用[https://mp.weixin.qq.com/s/PXxkXJf3IORul_9Si24__w]...
vcf格式是做变异(variant)分析的时候最常见的一种格式,主要包括一些header和位点的信息。可以参考这个说明文档学习:https://www.internation...
需求 客户的一个简单需求: 我有一批功能基因位点,想从重测序的群体材料中找到这些位点,如何批量快速获得? 示例文件 gene.txt test.vcf 代码实现 run.sh...
一、组蛋白结构 我们都知道在细胞核中的染色体是高度压缩的,而折叠时DNA缠绕的就是组蛋白。将组蛋白区域放大,我们就会看到这样一串念珠,组蛋白被一根DNA序列串起来。 “核小体...
1. 简介 超几何分布(hypergeometric)是统计学上一种离散概率分布。它描述了由有限个物件中抽出n个物件,成功抽出指定种类的物件的个数(不归还)。 超几何分布和F...
下面实例搬运自patchwork官网:https://patchwork.data-imaginist.com/articles/patchwork.html[https:/...
简述: 小提琴图 (Violin Plot) 用于显示数据分布及其概率密度。这种图表结合了箱形图和密度图的特征,主要用来显示数据的分布形状。中间的黑色粗条表示四分位数范围,从...
一、 创建一个随机矩阵10x20 二、作图1.基本作图 scale是指对数值进行均一化处理,在基因表达量的数据中,有些基因表达量极低,有些基因表达量极高,因此把每个基因在不同...
parallel是一个Linux命令行并行工具(mac也可以用) 1.安装 2. 用法 这里只说一种简单的用法,基本上能满足日常工作需求,假设当前目录有三个 *.txt 文件...
最近看了几篇关于共线性分析的微信/简书推送,发现不少研究人员把“编码基因共线性”错误地描述为“全基因组共线性”。这是两个完全不同的概念,前者主要是基于蛋白水平,蛋白的保守性很...
lncRNA 70% 的人类基因组能够被转录,而其中仅有 1% ~ 2% 的转录本能够编码蛋白,余下 98% 均为非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)。在...
R语言接受命令行参数的三种方式 最近要用一下R的命令行,但是发现命令行参数不是很友好,就总结了一下目前常用的R的命令行参数的接受方法。 平常我们使用R语言的时候常常都是在交互...