GWAS大家都很熟悉了，随着目前越来越多的重测序文章的发表，可见如今SNP数据是非常的丰富，以及GWAS也发展了15年了，如今到了一个后GWAS时代。GWAS我也做了很多了，...
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简短介绍下如何用GCE确定GWAS阈值
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转座子（TE,散在重复）特征及其对基因组影响转自:https://www.jianshu.com/p/fd2b417ceff8[https://www.jianshu.com/p/fd2b417ceff8] 基因组中重...
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转座子对基因调控的作用本篇为转载，原创作者为AI写代码的DNA 义冠转座元件对基因调控的作用[https://mp.weixin.qq.com/s/PXxkXJf3IORul_9Si24__w]...
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VCF(variant call format)文件格式详解vcf格式是做变异(variant)分析的时候最常见的一种格式，主要包括一些header和位点的信息。可以参考这个说明文档学习：https://www.internation...
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如何从vcf文件中批量提取一系列基因的SNP位点？
需求 客户的一个简单需求： 我有一批功能基因位点，想从重测序的群体材料中找到这些位点，如何批量快速获得？ 示例文件 gene.txt test.vcf 代码实现 run.sh...
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富集分析（超几何分布）（Fisher's Exact Test）
1. 简介 超几何分布（hypergeometric）是统计学上一种离散概率分布。它描述了由有限个物件中抽出n个物件，成功抽出指定种类的物件的个数（不归还）。 超几何分布和F...
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pheatmap
一、 创建一个随机矩阵10x20 二、作图１.基本作图 scale是指对数值进行均一化处理，在基因表达量的数据中，有些基因表达量极低，有些基因表达量极高，因此把每个基因在不同...
