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转自“果子学生信” 一、首先获取用于转换的probe2symbol文件: 第1种方法 直接用平台数据(网络不好的可以直接略过) 转换成数据框形...
转自果子学生信1.加载R包获取数据 2.通过pData函数获取分组信息 3.通过exprs函数获取表达矩阵并校正 4.判断是否需要进行数据转换 ...
一、 创建一个随机矩阵10x20 二、作图1.基本作图 scale是指对数值进行均一化处理,在基因表达量的数据中,有些基因表达量极低,有些基因表...
例:查看pData 其中title部分告诉了我们分组信息,2小时和18小时,每个时间段又有vehicle control, PE1.3 embo...
仔细观察下面的两个代码: 首先是不需要差异比较矩阵的: 然后是需要差异比较矩阵的: 两者结果是一模一样的。而差异比较矩阵的需要与否,主要看分组矩...
(转自http://www.bio-info-trainee.com/)需要三个数据: 需要三个步骤:表达矩阵...
转自http://www.bio-info-trainee.com/1399.htmlgpl organism ...
下载GSE 过滤表达矩阵 删除表达量低的探针,取最大表达量 探针名转为基因名 制作分组矩阵 制作差异比较矩阵 lmFit eBayes topT...