image.png Generating FASTQs with cellranger-atac mkfastq Overview cellranger-atac软件提供了c...
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"牛津纳米孔技术公司(Oxford Nanopore Technologies,ONT)开发的第三代测序平台是 目前唯一能够直接对天然RNA链进行测序的技术平台。ONT - ...
之前使用的是3D-DNA流程做Hi-C的辅助组装,它的最大优势就是输出结果可以对接下游的JBAT(juicerbox with Assembly Tools)进行手动矫正。然...
ChIP-seq、ATAC-seq等获取到基因组范围内的peak后,需要对其进行基因注释以便进行后续的分析。ChIPseeker做为peak注释的R包,用来很不错,但有时...
参考学习资料:https://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/GeneOverlap/inst/do...
学习目标 学习用DiffBind流程评估两个样本间的差异结合区域 用PCA评估样本间的关系 评估不同工具得到的差异peaks的一致性 评估差异peaks富集的工具 ATAC-...
简介 wildfly是一个非常强大的工具,我们可以轻松的使用wildfly部署应用程序,更为强大的是,wildfly可以很方便的部署cluster应用。 今天我们通过一个例子...
前几天学习了文献CUT&Tag[https://www.jianshu.com/p/335aec753039],了解了原理以后,可以跟着官网来学习如何分析CUT&Tag数据了...
这次要练习的文章数据出自:Spatially and functionally distinct subclasses of breast cancer-associated...