五.种群历史与基因交流 书接上回https://www.jianshu.com/p/0147afc3334c[https://www.jianshu.com/p/0147af...
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二代群体遗传与重测序（下） -
第九章 多变量群落分析1微生物群落研究的主要目标是比较不同群落的组成(β多样性)。在第6章介绍了β多样性，并举例说明了如何计算β多样性指数。得到β多样性指数后，可以对其进行统计分析。微生物群研究中的...
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用R中iheatmapr画交互式heatmap我之前写过一篇用R中pheatmap画heatmap这篇实践一种交互式的方法 iheatmapr参考这里：iheatmapr包：可交互的热图绘制方法——生信宝典iheatma...
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R包vegan的Mantel testsR包vegan的Mantel tests Mantel tests是确定两组距离测度矩阵（而非两组变量矩阵）之间相关性的相关性测试方法，用于判断一个矩阵中的样本距离与另一矩阵...
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如何利用NR库快速进行物种鉴定
作者：charon审稿：童蒙编辑：angelica 引言 在做基因或者蛋白质功能注释的时候，NR数据库包含非常重要的信息。但是有没有人跟我一样遇到相同的苦恼，就是在运行的时候...
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ggplot2绘制一个高端的venn图
venn图在论文中的作用与地位也许不如其它图形那么重要，因此本文主要不是教大家如何画一个高端的venn图，而是通过整个画图过程中的代码来介绍一些重要的画图函数而已，希望各位观...
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ggplot2绘制最美版相关性热图本节来解答群中小伙伴的一个问题，绘制一个更富有美感的相关性热图，在原有的画图基础上加了一下小小的改动https://mp.weixin.qq.com/s/FrPaME-OwI...
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ggplot2绘制进阶版物种组成图
之前写过一些微生物多样性的后续可视化的文档，感觉当时水平有限写的一般般没什么新意，今天重新来进行一下数据可视化分析，绘制一张更加富有美感的物种组成图，喜欢的小伙伴可以加入的我...
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微生物多样性qiime2分析流程(9) 数据可视化分析(中）之绘制相关性热图前面介绍了微生物多样性如何整合数据并进行了基础可视化分析，现在让我们开始进行更加深入的相关性分析和差异分析（相关性热图，RDA，CCA，Lefse） 1. 相关性热图 一般我...
