Smart-seq: Smart-seq2的前身是Smart-seq,它是首个用于单细胞转录组测序的方法。Smart-seq的提出可以追溯到2012年,它的原理是通过在反转录...
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4.cellranger aggr[https://support.10xgenomics.com/single-cell-gene-expression/software/...
使用 cellranger提供了五个分析模块用于分析单细胞转录组相关产品 1.cellranger mkfastq[https://support.10xgenomics.c...
上一节我们学习了10X Genomics[http://bioschool.cn/omics/scrna/10x-genomics/]的测序原理,这节我们来看看如何使用官方推...
grep 是一个在Linux/Unix系统中用于搜索文本的强大命令。它通过正则表达式来匹配文本,并输出包含匹配模式的行。以下是 grep 命令的基本用法和一些常见选项。 基本...
背景:单细胞ATAC分析流程介绍。 1.为什么做单细胞ATAC分析? 单细胞转录组分析的是单细胞分辨率上不同细胞之间的转录组(mRNA)差异,由中心法则可以知道,生物发生的过...
生信分析中最常见的数据格式应该就是fastq了。我们最初拿到的数据也是fastq格式。通常情况下,原始下机数据经过拆分之后获得的数据中会包含有低质量、N(未知碱基)、接头序列...
感谢大佬的帮助!
使用的示例文件如下: 输出指定列: 指定分隔符: 注:FS的优先级高于-F,即同时指定-F和FS时会使用FS参数 插入字段: 解释:默认-F参数为空白或者Tab键,1表示第一...
简介 AWK[https://www.gnu.org/software/gawk/manual/gawk.html] 是一种处理文本文件的语言,是一个强大的文本分析工具。 之...
VIM 是 Linux 系统上一款文本编辑器(程序开发工具),它是操作 Linux 的一款利器,由vi发展而来。 vim有三种模式,分别为命令模式(Command Mode)...
不看后悔系列!!!!!!之杯子良心回答。 好吧,我终于来这个话题下,分享一下我的心路历程。 向你保证所有此类内容,收藏这一篇就够了!!! 2018年五月开通了我自己的公众号,...
数据类型 在Python中,有许多内置的数据类型,包括但不限于以下几种: 1.整数(int): 表示整数,例如:x = 5。 2.浮点数(float): 表示带有小数点的数值...
本节开始,我们将详细介绍Python编程环境的搭建,工欲善其事必先利其器,所以我们这里先介绍python详细安装教程。由于Python是跨平台的,他可以运行在Windows、...
Python 是一种高级、通用、解释型、面向对象的编程语言,由Guido van Rossum在1989年底和1990年初创建。以下是 Python 的一些关键特点和信息: ...