问题 安装R包（seqinr）时遇到以下问题（缺少config文件）： 从报错信息可以看出报错根本原因是找不到zlib.h 问题解决： 1，确认是否安装zlib 注：上述命令...
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安装R包 fatal error: zlib.h: No such file or directory 问题解决
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生者为过客，死者为归人–读《谁在银闪闪的地方，等你》在华人的世界里，大家都愿意歌颂生，却忌讳谈论死。生是希望，是延续，死是不可知的恐怖。 因为恐怖，所以焦虑。身体健康时，担心会得病，得了病以后，担心会死亡。我们急于逃离死亡的阴...
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TCGA|GEO可视化分析第1篇---相关性分析导读：今天有小伙伴问我，筛选完差异基因后，想看自己关注的基因和其他基因的关系，应该怎么做？那当然要先做一下相关性分析了！好，下面让我给大家娓娓道来...... 正文： ste...
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【R>>ggprism】Graphpad Prism绘图风格做科研的Graphpad Prism是避不开的一道关，那么是否可以用R来实现其绘图风格呢？在微信公众号例竟然发现一篇好文，《一行代码绘制Graphpad Prism风格学术表...
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【R>>配对样本】提取TCGA中的配对样本
肿瘤研究中，常常需要关注癌和癌旁组织，这个时候就需要找出这些配对样本。下面就来实战吧！ 1.下载counts数据转为TPM counts转TPM教程：【R>>IOBR】cou...
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【R>>DepMap】单基因肿瘤细胞表达情况CCLE是肿瘤细胞基因表达的百科全书，之前写CCLE：求任意基因的相关性[https://www.jianshu.com/p/59f979ab09ee]稍微介绍过其用法。今天...
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CCLE：求任意基因的相关性进行肿瘤的研究，求两个或多个基因的相关性，可以用GEPIA2或者直接下载数据用R语言处理，如果能再加上细胞系的相关性就能完美了。下面就分享下，手动下载CCLE测序数据，求任意...
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单基因TCGA的Cox森林图怎么画才好看首先调取Xena网页的TCGA数据做Cox生存分析，数据可以通过hiplot官网自主研发的ucsc-xena-shiny直接在线获取访问https://hiplot.com....
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TCGA+biomarker——Cox回归森林图
森林图简介 森林图（forest plot），从定义上讲，它一般是在平面直角坐标系中，以一条垂直于X轴的无效线（通常坐标X=1或0）为中心，用若干条平行于X轴的线段，来表示每...
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单基因的肿瘤细胞系表达怎么看？CCLE告诉你泛癌的基因表达量一般可以用TCGA和GTEx实现，但是肿瘤细胞系一般用CCLE临床生信之家[https://www.aclbi.com/static/index.html#/...
