前言 最近在跑一个很大的数据集，大概有3500条以上的基因序列，因为数量太大，跑树有点搞不定，特此来记录一下这个过程 超过3000个基因组iqtree直接跑断直接跑了iqtr...
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生信log6细菌全基因组建树|基于GTDB-KT抽单拷贝蛋白序列-iqtree2 && fasttree建树
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7.1 GWAS：系统进化树——MEGA系统发育树 系统发育树是表明被认为具有共同祖先的各物种/材料之间的演化关系树形图，用来描述物种（或材料、序列等）之间的分类和演化关系，是反映群体结构最经典、直观、有效的方法；...
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MEGA 构建进化树步骤
【转载】 分子进化的研究对象是核酸和蛋白质序列。研究某个基因的进化，是用它的DNA序列，还是翻译后的蛋白质序列呢？序列的选取要遵循以下原则：1）如果DNA序列的两两间的一致度...
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MEGA 构建进化树网络上关于构建进化树的教程非常多，这里只挑重点部分讲解。 常见算法：Neighbor-Joining、Maximum Likelihood 1. 参数设置： Test of ...
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GATK4变异检测（bwa+samtools+Picard+GATK）一.软件下载安装 🔸bwa：https://github.com/lh3/bwa[https://github.com/lh3/bwa]安装及命令详解参考：http://st...
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生信 | ATAC-Seq基础分析+高级分析+多组学分析写在前面 其实很多作者已经探索的差不多了，相关脚本、教程也很多，但我还是自己系统的总结一下吧。有时候感觉是浪费时间，但是在写的时候能发现并学习到很多新的知识，不断记录反思，也...
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Harvard FAS Informatics出品的ATAC-seq测序指南
Harvard FAS Informatics出品的ATAC-seq测序指南 github链接：harvardinformatics/ATAC-seq 参考文献：ATAC-s...
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转载ATAC-Seq、ChIP-Seq、RNA-Seq整合分析
转自：生信技能树这是目前发现不错的ATAC系列，原作者在简书也有更新https://www.jianshu.com/u/d5b900bea027 ATAC系列连载： ATAC...
