前言 我是在y蜀黍的书里(搜索clusterProfiler book 即可找到)看到了一个叫msigdbr的包，就是把MsigDB的那些基因集合都R语言化了。那么以后想做G...
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GSEA和GSVA，再也不用去下载gmt文件咯 -
Endnote使用入门新建库新建库相当于开了一个自己的图书馆用来存放文献存放目录自己选择存放位置会生成两个文件一个.enl文件、一个.Data文件夹 创建组 导入文献 在线搜索示例：PMID：30...
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1.基于秩序关系的个体化分析方法前言 批次效应是测量结果中的一部分，它们因为实验条件的不同而具有不同的表现形式，并且与我们研究的变量没有关系。一般批次效应可能在下述情形中出现： 一个实验的不同部分在不同时间...
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3.GSVA 基因集变异分析简单来说，就是将分析对象由基因换成了基因集，进行基因集（通路）级别的差异分析。 原理： 与GSEA类似，可以将计算每个样本中特定基因集的富集分数，（量化通路，可以理解为通路活...
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2.GSEA基因富集分析GSEA（Gene Set Enrichment Analysis） 背景 传统KEGG和GO通路富集分析分析：富集到同一个通路下的有上下调基因，则这条通路的总体表现形式不好...