1. 原理介绍 官网:https://github.com/immunogenomics/harmony[https://github.com/immunogenomics/...
一、seurat执行差异表达分析 根据单细胞数据预处理的方式不同(lognormalize和sctransform),执行差异表达分析代码有所不同,这个需要注意。我当时请教过...
satijalabsctransform包的github网址:https://github.com/ChristophH/sctransform[https://github...
Seurat 4.?升级Seurat5报错 lazy loading failed for package 'Seurat' 报错 lazy loading failed f...
1. 学习目标 讨论为什么归一化计数对于细胞之间的准确比较是必要的 解释如何通过主成分分析 (PCA) 评估细胞之间的相似性 在获得高质量单细胞后,scRNA-seq分析工作...
了解PCA降维原理的同志们,一定都知道PCA的核心是在数据的高维空间里面,寻找出合适的一组向量(向量之间相互正交),并利用这一组向量作为新坐标系的基底,使得高维空间的数据点投...
前言 想要白嫖子宫内膜癌的单细胞测序数据用来做验证,搜到一篇做的很全面的单测文章,但作者上传的是SRA文件,只好拾起3年前跟生信技能树曾老师启蒙的上游数据分析技能。 网上一顿...
写在前面 其实很多作者已经探索的差不多了,相关脚本、教程也很多,但我还是自己系统的总结一下吧。有时候感觉是浪费时间,但是在写的时候能发现并学习到很多新的知识,不断记录反思,也...
两种都是由于windows和Mac的机型问题 Mac机型解决方案: 用allowWGCNAThreads() 替换 enableWGCNAThreads()
网络爬虫(web crawler),也叫网络蜘蛛(spider),是一种用来自动浏览万维网的网络机器人。其目的一般为编纂网络索引。各大搜索引擎都可以被看做爬虫,根据爬取的内容...