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1. 学习目标 讨论为什么归一化计数对于细胞之间的准确比较是必要的 解释如何通过主成分分析 (PCA) 评估细胞之间的相似性 在获得高质量单细胞后，scRNA-seq分析工作...

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了解PCA降维原理的同志们，一定都知道PCA的核心是在数据的高维空间里面，寻找出合适的一组向量（向量之间相互正交），并利用这一组向量作为新坐标系的基底，使得高维空间的数据点投...

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前言 想要白嫖子宫内膜癌的单细胞测序数据用来做验证，搜到一篇做的很全面的单测文章，但作者上传的是SRA文件，只好拾起3年前跟生信技能树曾老师启蒙的上游数据分析技能。 网上一顿...

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写在前面 其实很多作者已经探索的差不多了，相关脚本、教程也很多，但我还是自己系统的总结一下吧。有时候感觉是浪费时间，但是在写的时候能发现并学习到很多新的知识，不断记录反思，也...

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两种都是由于windows和Mac的机型问题 Mac机型解决方案： 用allowWGCNAThreads() 替换 enableWGCNAThreads()

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网络爬虫（web crawler），也叫网络蜘蛛（spider），是一种用来自动浏览万维网的网络机器人。其目的一般为编纂网络索引。各大搜索引擎都可以被看做爬虫，根据爬取的内容...

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日常瞎掰   奇奇怪怪的事又发生了，真就应了那句话，不出意外的话，意外就会发生了。。。  最近需要用clusterProfiler做KEGG富集，然后就出现了意外，居然出现N...

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LncRNA的概念及功能 LncRNA的概念 长链非编码RNA（long non-coding RNA, LncRNA）是一类长度大于200nt但不编码蛋白质的非编码RNA，...

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摘录：生信技能树论坛 Kai statquest 要求：实现这个功能的软件也很多，还是烦请大家先自己搜索几个教程，入门请统一用htseq-count，对每个样本都会输出一个表...

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Notch信号传导通路是决定细胞命运的最重要的通路之一。Notch通路比较复杂，主要由四部分组成：Notch受体、Notch配体、CSLDNA结合蛋白、下游靶基因。其中任何一...