ATAC-seq信息分析流程主要分为以下几个部分：数据质控、序列比对、峰检测、motif分析、峰注释、富集分析，下面将对各部分内容进行展开讲解。 一、测序数据过滤与质量评估 ...
IP属地：上海
-
ATAC-seq专题---生信分析流程 -
-
WGCNA原理和分析流程WGCNA全称weighted gene co-expression network analysis，即加权基因共表达网络分析。它是一种分析多个样本基因表达模式的分析方法，...
-
思路清奇SCI20.EMT+胶质瘤.6.6分预后模型在肿瘤中地位非凡，今天在看文献中发现一篇挺独特的文献。下面就来欣赏下： 作者考虑到 在胶质瘤中作用比较大，再结合EMT在 进程中的作用，构建EMT联合CSC判断肿瘤预...
-
10X单细胞（10X空间转录组）之单细胞精度分析细胞通讯开工了，到了我们上班的时间了，刚开始，我们来分享一些新出现的方法，看看方法上有哪些更新，我们虽然做不了潮流的引领者，但是要跟随潮流，保证自己不被时代抛弃，今天分享的文献在Co...
-
单细胞辅助注释工具-SingleR很多做单细胞的研究者都提出过这个问题，是否有直接的功能能对单细胞直接进行注释，而不是繁琐的参看文献，搜索marker，人为对单细胞进行注释。单细胞真的可以实现自动化注释吗？我...
-
免疫细胞注释-2：髓系细胞scRNAseq免疫细胞注释： 免疫细胞注释-1：T细胞[https://www.jianshu.com/p/0127c9b380c9] 免疫细胞注释-2：髓系细胞[http...
-
2020-08-29 单细胞注释用到的基因标志物传统的方法是无监督聚类+群标志物分类；或者根据已有单细胞数据集作为参考CellAssign工具提出了一种根据已知gene marker set+贝叶斯模型&EM算法的分类方式...
-
RNA-seq分析简洁版前面RNA-seq分析：从软件安装到富集分析部分已经把转录组全部流程走完了一遍，这次利用RNA-seq(2)-2:下载数据中下载的肝癌数据进行分析，不在赘述细节，所以有看细节...
