在做完GO富集[https://www.jianshu.com/p/71278efdaad9]之后，我们可以得到这样的富集分析结果，在结果里可以看到有两列是GeneRatio...
发简信
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富集倍数Fold Enrichment的计算方法 -
@11103749e3d7 请问您解决了吗，我也找不到
【基因组注释】ncRNA注释
1. ncRNA 非编码RNA(Non-coding RNA, ncRNA) 包括rRNA，tRNA，snRNA，snoRNA 和microRNA 等不编码蛋白质的RNA，它...
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中科院硕博生一枚，用简书来记录自己精读paper和学习生信的过程。
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JCVI(MCscan Python version)使用记录文章仅是记录自己的学习使用，有错误请指出，我立刻改正！ 官方说明https://github.com/tanghaibao/jcvi/wiki/MCscan-(Python-...
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@斩毛毛 是的是的！感谢！
GeneMark-ES/ET安装与模型训练
GeneMarkGeorgia Institute of Technology开发的一系列基因预测工具。真核生物基因组预测主要会用到GeneMark-ES/ET, 其中Gen...
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请教一下老师，用genemark软件结果输入maker为什么会报错呢
You have failed to provide a value for 'gmhmme3' in the control files
You have failed to provide a value for 'probuild' in the control files.GeneMark-ES/ET安装与模型训练
GeneMarkGeorgia Institute of Technology开发的一系列基因预测工具。真核生物基因组预测主要会用到GeneMark-ES/ET, 其中Gen...
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同问第2个模块一直找不到怎么解决呢
安装GeneMark-ET遇到的错误
在安装GeneMark-ET软件时：一直卡在以下错误中 Can't locate Hash/Merge.pm in @INC (you may need to install...
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如何对基因组序列进行注释基因组组装完成后，或者是完成了草图，就不可避免遇到一个问题，需要对基因组序列进行注释。注释之前首先得构建基因模型，有三种策略： 从头注释(de novo prediction...
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基因组结构注释软件列表
基因组结构注释主要包括三个方面：从头注释（de novo prediction）、同源注释（homology-based prediction）以及基于转录组数据注释（tra...
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SNP数据构建系统进化树大概是长期的不锻炼使得今天的爬山运动过量了，接着悲剧就是无法入眠。也幸亏明天是周日，干脆就起床码字了。总结下自己前面用snp构建系统进化树的方法吧。 1.构建进化树的算法 构...
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请问老师，如果预测出的基因数目远远高于已发表文章中的数目，模型方面有哪些可以调整？
使用MAKER进行基因注释(高级篇之AUGUSTUS模型训练）
准备训练集和测试集 根据Augutus的官方教程，可靠的基因结构序列的要求如下： 提供基因的编码部分，包含上游几KB。通常而言，基因越多，效果越好，至少准备200个基因以上。...
