在做完GO富集[https://www.jianshu.com/p/71278efdaad9]之后,我们可以得到这样的富集分析结果,在结果里可以看到有两列是GeneRatio...
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文章仅是记录自己的学习使用,有错误请指出,我立刻改正! 官方说明https://github.com/tanghaibao/jcvi/wiki/MCscan-(Python-...
genemark-原核GeneMarkS genemark-真核GeneMark ES/ET genemark在README中详细介绍了为什么程序叫gmes_petap.pl...
基因组组装完成后,或者是完成了草图,就不可避免遇到一个问题,需要对基因组序列进行注释。注释之前首先得构建基因模型,有三种策略: 从头注释(de novo prediction...
基因组结构注释主要包括三个方面:从头注释(de novo prediction)、同源注释(homology-based prediction)以及基于转录组数据注释(tra...
比对到转录本,预测基因 使用TransDecoder将结果整理成evm输入格式 第一步整理后:
大概是长期的不锻炼使得今天的爬山运动过量了,接着悲剧就是无法入眠。也幸亏明天是周日,干脆就起床码字了。总结下自己前面用snp构建系统进化树的方法吧。 1.构建进化树的算法 构...
什么是K-mer? mer : 分子生物学领域中意义为:monomeric unit ( mer) :单体单元,相当于nt或者bp。通常用于双链核酸中的单位,100 mer ...
1. 什么是单倍型? 同源染色体:同源染色体,一个来自母本,一个来自于父本。 单倍型:单倍体基因型的简称。遗传学上指在单条染色体上一系列遗传变异位点的组合。 2. 单倍型组装...