WGCNA图文详解(七)-eigengene network的可视化 还是老习惯，给出官网教程，至于你是看还是不看，它就在那里，等着你的深入研究～ https://horva...
发简信
IP属地：黑龙江
-
小鬼的WGCNA图文详解(七)-eigengene network的可视化 -
WGCNA（2a）：一步法完成网络构建和模块检测在上一篇帖子上完成了表达量数据和表型数据的整理，这篇文章将进行网络构建和模块检测。 WGCNA（1）：R包安装及数据导入清洗 - 简书 (jianshu.com)[https...
-
WGCNA（1）：R包安装及数据导入清洗WGCNA：加权基因共表达网络分析，简而言之，就是将基因划分为若干个模块，探究与表型数据与基因模块之间的相关关系，并找到模块中的核心基因。 适用于复杂的数据模式，推荐5组(或...
-
WGCNA（2b）：分步法完成网络构建和模块检测
在前两篇帖子中介绍了数据的导入清洗，以及一步法构建网络，这篇文章将介绍网络构建的第二种方法，分步法。WGCNA（1）：R包安装及数据导入清洗 - 简书 (jianshu.co...
-
-
实操|rrBLUP包RRBLUP数据处理 VCF转为 rrBLUP {-1,0,1} 格式 rrBLUP可识别的基因型格式为 {-1,0,1} （行头为marker，列为sample），因此需要对基本数据...
-
「GATK 4」如何提高HaplotyperCaller的效率GATK的HaplotypeCaller 应该是目前最常用的变异检测软件，尤其是在人类基因组上。不过HaplotypeCaller的速度相对于其他软件，例如bcftools,...
-
3. SNP Calling以GATK流程为例，简单来说，SNP Calling主要包括以下几步： 1. 给参考基因组建立索引：samtools faidx、bwa index, gatk Create...
-
GATK4.1 call SNP
GATK4.0 和之前的版本相比还是有较大的不同，更加趋于流程化。 软件安装 点击此处 查看最新版本 GATK 简单说明 GATK分析简要流程 所需数据 ref.fa rea...
