1.没有账号的需要先注册，审核要三天左右，如果学校之前没人购买过，一般不会给你审核。这时候就直接发邮件购买，在它们的官网下载购买模板，然后填写信息。 他们收到订单之后，返回需...
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拼接序列为什么会出现短序列？扩增子测序双末端序列拼接的时候，往往会出现短序列 这些小于400bp一下的序列是否属于我们想要的呢？ 短序列93 短序列146 短序列294 过滤长度小于396的序列 过滤所...
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MSKCC Research Associate<br>别赶不上野心，又辜负了努力
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IQ-TREE的使用 - 超快速用极大似然法构建进化树
写在前面 我知道IQ-tree已经有很长一段时间了。不过我一直并没有使用它。主要原因是，常用的快速构建ML树的软件是FastTree，如果要求准确，我会在服务器上使用RaxM...
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ANI AAI TETRA Mash比较基因组导读 比较平均核酸一致性average nucleotide identity（ANI）和氨基酸一致性amino acid identity（AAI）是比较基因组常用的两种基...
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使用anvi'o 进行微生物pangenomics泛基因组分析1.数据下载 2.数据解压 2.泛基因组数据库的构建 泛基因组分析 后面还可以对其泛基因组功能进行分析，感兴趣的大家去anvio网站学习吧！
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10-【BPGA】的安装和使用
安装时间：2021.2.17 1. 简介 BPGA是一款快速的泛基因组分析软件。似乎好像在windows上安装较为方便。在Linux下没有conda安装版本，只能手动进行安装...
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GTDB-tk注释细菌基因组文献 1标题：A complete domain-to-species taxonomy for Bacteria and Archaea[https://www.natur...
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CA (Correspondence Analysis)笔记内容：CA(Correspondence Analysis)CA的R实现、作图及解读与logistic regression的差别 CA(Correspondence A...
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2021-06-07 AAI计算一、AAI 氨基酸一致性amino acid identity（AAI）是获得属或更高分类群分类结构的一种客观方法。常用工具： CompareM：github说明[https...
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6-【FasTtree、RAxML-NG、IQtree】的安装和使用（2021.3.16更新）初次记录时间：2021.2.5 3.12更新说明：ML建树对与模型的替代选择比较敏感，因此增加了第四部分推测最佳模型的方法：jModeltest和ProtTest。3.16更...
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2021-6-7 UBCG使用一、软件说明 引用此软件：Na, S. I., Kim, Y. O., Yoon, S. H., Ha, S. M., Baek, I. & Chun, J. (2018)....
