对拼接结果进行纠错,或者称为抛光。既可以使用二代测序数据,也可以使用三代数据。 pilon pilon 是一款基于二代测序数据进行纠错的软件,比较消耗计算资源。要求输入为比对...
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对拼接结果进行纠错,或者称为抛光。既可以使用二代测序数据,也可以使用三代数据。 pilon pilon 是一款基于二代测序数据进行纠错的软件,比较消耗计算资源。要求输入为比对...
日常瞎掰 工欲善其事必先利其器,好用的工具对做事来说很重要,可以让你做起事来收到事半功倍的效果。前段时间分析数据时,需要给intervals做基因注释,需要操作gtf文件...
00 写在前面 测序后公司交付数据时,一般会提供质控后的clean data和后续的基础分析结果。因为可能需要自己来进行数据的预处理,记得一定要拿回raw data,同时弄清...
今天跟大家分享的工具可以是用来处理带有分子标签(Unique Molecular Identifiers,UMIs)和细胞条形码(cell barcode)的数据。目前来说,...
首先来看一下这款软件的功能概况: StepInputsOutputFind Cell barcode whitelistRead 1 fastqwhitelist.txtEx...
fastp去umi测试 在二代测序中,由于文库的质量偏低,通常需要增加umi以标记reads序列常规有使用一下两个方法进行去umi: 方法一:使用-U的命令 fastp -i...