@23c0dd34d224 用服务器了
Day3-单细胞数据fastq及cellrangerSRA-fastq-cellranger 1.conda安装和管理 2.设置镜像 3.创建环境 4.conda安装相关软件 5.Fastq 其中主要使用的参数:–gzip:将...
@23c0dd34d224 用服务器了
Day3-单细胞数据fastq及cellrangerSRA-fastq-cellranger 1.conda安装和管理 2.设置镜像 3.创建环境 4.conda安装相关软件 5.Fastq 其中主要使用的参数:–gzip:将...
通过前面的数据下载,我们一般都可以得到如下矩阵,为了后续分析及文章需要,我们则需要吧探针名转化为gene_symbol ID转化主要分为二步 Ⅰ、得到探针一一对应的基因名Ⅱ、...
T 细胞(全部):CD3+ Naive T cell: CD3, CD4, CCR7, CD62L+, IL-7R (CD127), THPOK Tef(效应T细胞): 辅助...
安装R包 读取iris数据 1.新增列 新增一列:方法一mutate(test, new = Sepal.Length * Sepal.Width) 新增一列:方法二test...
1.设置工作路径 setwd('/mnt/SSS/database/Day5') 2.读取doudou 先看看长什么样子 再来看一下huahua 两列之间有空格,所以sep里...
昨天cellranger完后在outs文件夹里面就有这三个文件了,随后就可以在R里面读取这个单细胞数据了。 1.加载R包及读取数据 cellranger完一共有14个数据,8...
SRA-fastq-cellranger 1.conda安装和管理 2.设置镜像 3.创建环境 4.conda安装相关软件 5.Fastq 其中主要使用的参数:–gzip:将...
Linux下载单细胞数据 数据准备 首先找到你想要的数据库,我这边选择gse155513,然后点击 SPR274643image.png 在Send to选择File,For...
学习单细胞WGCNA(一) 学生信的或多或少都听说过WGCNA,其实就是一种相关性分析,你设置一种表型,然后就能找到几群相关表达的基因,具体内容就不啰嗦了,网上介绍的资料很多...