写毕业论文的时候老板提到要用一张图表示分类系统的变化，于是像到用桑基图来呈现这个变化的过程，具体操作步骤如下（越来越不喜欢写注释了，大家将就着看）：输入表格如图：
发简信
IP属地：福建
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桑基图——不同系统发育框架比较 -
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gene.fa去重复
使用序列进行同源比对时需先根据gene.fa创建参考库有时提取的gene.fa中基因名有重复会报错BLAST Database creation error: Error: ...
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从gb文件中提取基因与间隔区的序列（fasta文件）脚本：get_annotated_regions_from_gb.py[https://github.com/Kinggerm/PersonalUtilities/blob/...
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可以从fasta中提取基因序列的4款软件
前言 做生分析有时候需要从基因组fasta文件中提取基因的序列，对于这个需求有不少现成的软件可以来实现，今天来跟大家分享4款可以完成这个需求的软件，废话不多说了，直接来看...
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古文献の引用メモ（古文献的引用笔记）【引介，非转载】古文献を引用する時はどの単語が何を意味しているのかかなり難解で苦労したので、私が理解した文献をメモしておきます。（在引用古文献的时候，因为很难理解哪个单词是什么意思而很辛苦，...
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2023-12-13 | ggplot-采样地图绘制需要数据格式 前两列是经纬度，第三列是品种或亚型，第四列是每个品种的数量分布 画图 结果展示 ! 代码来自文章，稍作修改 Gu, S.; Qi, T.; Rohr, J. R...
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基因流分析——Treemix基本概念： 基因流（也称基因迁移） 是指从一个物种的一个种群向另一个种群引入新的遗传物质，从而改变群体“基因库”的组成。通过基因交流向群体中引入新的等位基因，是遗传变异一个非...
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R Pheatmap包 画热图，自定义颜色条，保存PDF
R Pheatmap包 画热图，自定义颜色条，保存PDF 采用colorRampPalette 定义颜色条自定义函数save_pheatmap_pdf 来 定制化保存PDF ...
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《R数据可视化手册》学习笔记5---散点图（4）图形重叠 透明度
写在前面。 散点图通常用来刻画两个连续型变量之间的关系。每个点代表一个观测值。 图形属性 设置或者映射变量给图形属性可以展示更多的信息并使图形更美观和丰富。 散点图的属性包括...
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bgzip 压缩文件，tabix 建索引
在对 vcf 文件压缩时，不可以用 gzip 来代替 bgzip； 压缩 bgzip -f view.vcf 解压缩 bgzip-d view.vcf.gz 或者gunzi...
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fasta、sam、bam相互转换
导读 fasta、sam、bam相互转换。总结一下，可能不是最好用的方法。 一、fasta <=> sam 1. fasta => sam 2. fasta <= sam 二...
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植物新属与属下等级，模式与模式指定
新属与属下等级的名称 属名是首字母大写的单数主格名词，或被如此处理的词，属名可以是任何来源，甚至可任意构成，但不能以 -virus 结尾（20.1）。属下分类群（subdiv...
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R语言: scale()
对一组数值数据进行标准化 基本语法scale(x,center=,scale=)x : 进行归一化的对象，可以是向量、矩阵或数据框，但其中的元素必须都是数值center : ...
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使用bammtools对bamm分析结果可视化BAMM的全称是Bayesian Analysis of Macroevolutionary Mixtures，使用的方法就是贝叶斯，运行后首先就要看看运行是否收敛 结果如下...
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PAML-discussion-groupHi PAML Users,Welcome to the PAML discussion group. This site is for posting questions...