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先前我使用Geneminer组装分子标记,但在下游分析出现了bug,我尚不能确定是组装流程的错误还是测序的过失,故而使用Hybpiper就bug...
出现破碎化的基因组组装(不成环,图1),通常是DNA提取、建库等上游实验流程的过失,在不影响(方便)下游分析的情况下,是可通过一些措施弥补的。并...
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缘起:课题组需要组装一批物种的matK、rbcL与ITS分子标记,用于后续的生态学研究。 对于matK、rbcL与ITS这类常用分子标记...
有时候我们需要将fasta文件中的多行碱基转为单行,方便后续的数据提取,使用seqkit seq -w 0实现,即: