1.利用箱线图比较两类样本的某个细胞比例差异 比较直观，但是缺点在于如果单细胞样本个数过少且异质性大，导致很难有统计学显著意义 2.R o/e 比值 好多文章都有用这个，我的...
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单细胞细胞比例分析方法列举 -
机器学习入门总结和各类常用神经网络汇总(第一篇)这里总结了李宏毅老师的机器学习的课程。首先我们将会了解到机器学习的概念，但是课程的主要观点将会聚焦到Deep Learning。进行了解之后我们会学习到监督学习( super...
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SignatuR的使用简介SignatuR包属于较为简单的数据库类型的R包，其中已包含了多个生物学过程和细胞类型特异性基因集，基因集的排列方式呈树形结构，简单明了，在使用过程中我们可以添加或删除其中的...
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去医院却撞见老公全家陪别的女人产检，我淡定拿出老公的不育报告，让他们狗咬狗
我被篮球砸伤了脚踝，被送到医院后，竟然遇到我老公全家，陪另一个女人产检。 平时对我的冷言冷语的小姑子吴彤彤挽着小三的胳膊，婆婆也嘘寒问暖。 我的老公在旁边一语不发，甚至和那个...
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论文阅读“ZINB-based Graph Embedding Autoencoder for Single-cell RNA-seq Interpretations”Yu Z, Lu Y, Wang Y, et al. ZINB-based Graph Embedding Autoencoder for Single-cell RNA-s...
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2022-04-07 张泽民老师文章选读之SciBet as a portable and fast single cell type identifier看了生信人公众号的推文，才发现张泽民老师的研究涉猎非常广，其中很多生信分析和分析工具我豆豆很感兴趣，近几天计划把老师的研究捋一捋，今天先就选出来的一些感兴趣的文章进行阅读。原...
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17万年前，智人吃什么？揭秘人类曾食用的巨型蜗牛大家好，欢迎来到今日的《科学快报》 人类曾经食用超大型蜗牛？这项实验揭示了史前文化的秘密 该研究发表于《自然》杂志 在匈牙利的一个古老遗址中，科学家们发现了一批巨大的蜗牛骨骼...
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溶酶体和线粒体共存的所思所得几年前，基于蛋白组数据，苦思冥想后提出一个可能的理论： 溶酶体和线粒体可以融合共存。也就是内体溶酶体和自噬体融合后，并未发生传统的线粒体完全被消化，而是像十几亿年前的原真核细...
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GSA、GSEA、ssGSEA、GSVA的算法原理及它们的联系与区别一、 简述 为了从基因的表达水平中得到更加具体直观的生物学功能变化的信息，多种基于已知的基因集的分析方法应运而生。其中，基因集分析（Gene Set Analysis...
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预支彩礼被男友拉黑，真的很渣吗？
最近，一个女生因为父亲生病，向交往五年的男友要求预支彩礼反被拉黑的事引起热议。 很多人认为男生渣，但仔细推敲，远非如此。 比如，拉黑背后的真相是：女孩父亲脑溢血治疗已逾70万...
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跟着Nature学作图：R语言ggplot2三角热图按照指定的角度旋转论文 Whole-genome doubling drives oncogenic loss of chromatin segregation https://www.nat...
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黄光裕：人生最大的悲哀是，等你满血复活，却早已没有了对手马尔克斯在《百年孤独》书中写道：生命中曾经有过的所有灿烂，终究都需要用寂寞来偿还，人生终将是一场单人的旅行，孤独之前是迷茫，孤独过后便是成长。 很显然亲手创造国美帝国神话的“...
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CIBERSORT 免疫浸润(2023.1.2更新版)目前主流的免疫浸润计算方法是CIBERSORT和ssgsea，今天介绍CIBERSORT。 1.输入数据要什么 下面这段话摘自CIBERSORT的介绍 Importantly...
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NetAct代码实操之单细胞转录因子分析的新时代
前言 Immugent在之前的一篇推文；NetAct:利用基因活性构建核心转录因子调控网络[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4MjY5...
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ConsensusClusterPlus: R中实现鉴定簇集数及其成员的算法无监督分析下鉴定簇集数及成员 Wilkerson, D. M, Hayes, Neil D (2010). “ConsensusClusterPlus: a class di...
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一个科研爱好者对Scientific reports的看法本人今年8月有幸中Scientific reports一篇，不催不黑，专家意见挺专业的，意见也比较客观，并提了4个方法学方面的问题，总体感觉不错。sr官网显示2019年接收率...
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circos软件学习笔记：更改染色体的比例、颜色、方向在这一节，我们将学习如何调整染色体绘画条数，以及改变它们的比例、颜色以及方向。 正确的ideogram的布局是非常重要的。比如说，使所有的染色体都是相同的大小可以强调模式中相...
