@huang_7 已经发表了，这篇文章有些多序列结果分析的流程啊。如果是多序列比对，是MUSCLE吧，结果分析这篇文章有提及。
用PLAM下的mcmctree做分歧时间估计用mcmctree做分歧时间估计的时候遇到报错： 问题是序列不符合phylip格式，每个名字没有区分开 1.使用以下命令行将orthofinder处理好的多序列比对结果，fa...
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@Yorleleiyo 不正常吧，用conda吧‘conda install -c bioconda cafe’
用CAFE做基因家族收缩扩张
以下基于cafe 5版本cafe5以前的版本，都需要写cafe.script,更麻烦，推荐版本5.常用的cafe参数为 input文件使用之前做的orthofinder得到的...
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2022年和三年计划
越是长大以后越是发现，所有的计划和目标，需要用至少三年的时间浇灌 总结我所存在的问题： 基本功方法和语言领域知识统计脚本语言肿瘤和医学数据数学python和RML基础 以上用...
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research proposal研究计划撰写的保姆级教程
申请PhD这段时间，光proposal就写了4份，而且1-2和3-4还是不同方向。第一份研究计划也是抓耳挠腮写了两个周还多，被老师点赞说“nice”。第三份研究计划因为要的时...
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@聪明小崽子 linux安装一般包括软件源安装比如conda，源代码编译。你说的git安装，我理解的是github下载软件，里面有多种安装方式。cafe5的官网document有很多安装的信息，只要你安装好了，不存在所谓的linux还是git,一个东西。
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你好，把这段代码的FALSE改为TRUE就可以了
关闭Chrome左右滑动时返回上一个网页
我用Mac电脑上用Chrome时，有一点非常不便让我常常无语。也不知道哪个工程师开发的功能，这么扯，每次用触摸板滑动浏览网页的时候，它会自动抓取你左滑动或者右滑动，变为返回上...
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2022年第二季度计划
第一个季度完成情况 上个季度的计划写的时候内容就很多，那时候又想补短板，把R语言进阶到写包水平，又刚好加入DAIR团队实习，有大量的深度学习工作要做。没想到自己能够基本完成，...
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@贪星的蘑菇 你能不能把你的mcmctree结果发给我看一下，因为orthofinder的结果有有很多，因为这个分析我做的时间很久了有点忘记了细节，不过我记得orthofinder是不做多序列比对的，多序列比对一般用MUSCLE,orthofinder是聚类的。你最好给我看看你的报错
用PLAM下的mcmctree做分歧时间估计
用mcmctree做分歧时间估计的时候遇到报错： 问题是序列不符合phylip格式，每个名字没有区分开 1.使用以下命令行将orthofinder处理好的多序列比对结果，fa...
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2022年第一季度计划
GCN实习 找了一份北大计算机学院的实习工作，老师的方向图卷积神经网络，我的目标是做GCN应用于生物领域。目标发表一篇文章，不要求点数高，只求口碑好。 R工具包 最近在给R打...
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@NEWwitch 你这个是ctl_tree.ctl里面有东西写错了，你看看你是不是参数（例如-a）写了没有具体的数值。还有一种可能性是你重复写参数了。建议你检查一下你的ctl_tree.ctl，先看是不是打错字和标点了，再看是否有重复的参数。
用PLAM下的mcmctree做分歧时间估计
用mcmctree做分歧时间估计的时候遇到报错： 问题是序列不符合phylip格式，每个名字没有区分开 1.使用以下命令行将orthofinder处理好的多序列比对结果，fa...
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如何写个生信软件之百家谈
剑锋 上海交通大学医学院附属瑞金医院、医学基因组学国家重点实验室在读研究生（2015年入学）主要感兴趣的研究方向：数据可视化；高通量测序数据分析方法开发；临床检测相关的软件和...
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关闭Chrome左右滑动时返回上一个网页
我用Mac电脑上用Chrome时，有一点非常不便让我常常无语。也不知道哪个工程师开发的功能，这么扯，每次用触摸板滑动浏览网页的时候，它会自动抓取你左滑动或者右滑动，变为返回上...
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@奶咖真好喝 利用Aa和核苷酸，其实是一样的，就是参数记得写成AA就行了。，但是我做的时候直接用的model=0,我认为模型不是最重要的。如果你一直报错，我认为应该是数据格式的问题。
用PLAM下的mcmctree做分歧时间估计
用mcmctree做分歧时间估计的时候遇到报错： 问题是序列不符合phylip格式，每个名字没有区分开 1.使用以下命令行将orthofinder处理好的多序列比对结果，fa...
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@晓栩 这个好难回答，你可以去官网查一下。你是哪种安装方法，自己编译源代码？
用CAFE做基因家族收缩扩张
以下基于cafe 5版本cafe5以前的版本，都需要写cafe.script,更麻烦，推荐版本5.常用的cafe参数为 input文件使用之前做的orthofinder得到的...
