@wow咪来哆 fasta或者fastq格式的数据都可以
hifiasm软件安装与使用HiFi测序以及hifiasm软件的使用,目前是市场上二倍体动植物基因组组装的最佳选择,没有之一,多倍体目前也是最佳选择,也正因为HiFi跟hifiasm软件,使得动植物基因...
@wow咪来哆 fasta或者fastq格式的数据都可以
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ANGSD软件可以基于比对好的bam文件,提取得到与比对用的参考基因组一致性的基因组,有了一致性基因组,可以根据对应参考基因组的gff3文件提取对应的原件进行比较分析,基于二...
超保守原件UCEs,(ultraconserved elements ),是在进化过程中,各个物种保留的一种保守序列,因此可以通过提取该类序列,从而分析各个物种的进化情况,相...
MITOS2可用于注释后生动物以及真菌等线粒体基因组注释,主要注释线粒体18个核心基因(atp6 atp8 atp9 cob cox1 cox2 cox3 dpo lagli...
启动子 启动子是RNA 聚合酶识别、结合和开始转录的一段DNA 序列,它含有RNA 聚合酶特异性结合和转录起始所需的保守序列,多数位于结构基因转录起始点的上游,启动子本身不被...
linux
WGDI软件(一):安装与配置前言 WGDI软件对于比较基因组分析非常实用,能够分析全基因组复制事件,识别同源区块,画共线性点阵图,求ka、ks值等,小编接下来先带你安装该软件 安装环境及配置软件 (1)...
作用不一样
一些常用小脚本记录记录下小编自己可能用到的小脚本 (1)fasta转phylip格式 用法:python fa2phy.py seq.fasta seq.phy (2)fastq转fast...
记录下小编自己可能用到的小脚本 (1)fasta转phylip格式 用法:python fa2phy.py seq.fasta seq.phy (2)fastq转fast...
@汪大山 是的,两个个体间的IBD
IBD分析软件germline安装与使用Identity by Descent (IBD) :同源相同片段,是在两个及以上个体存在来源于同一祖先的、未发生重组的、完全相同的DNA片段,这样的片段即为IBD片段,详情...
对于生信分析,经常需要从各种网址下载基因组,小编在此分享一些下载经验, (1)参考文献:对于一个科学研究者,可以直接找到研究物种已发表的基因组文献,一般情况下,文章会提供基因...
HiFi测序以及hifiasm软件的使用,目前是市场上二倍体动植物基因组组装的最佳选择,没有之一,多倍体目前也是最佳选择,也正因为HiFi跟hifiasm软件,使得动植物基因...
在linux系统创建新的账号后,界面显示基本上是黑白色的,这时需要添加显示的色彩,小编这里分享自己的界面配色: 将下面两行添加到~/.bashrc 若有侵权,联系删除
Identity by Descent (IBD) :同源相同片段,是在两个及以上个体存在来源于同一祖先的、未发生重组的、完全相同的DNA片段,这样的片段即为IBD片段,详情...
@05466c253c6d 我的就是双端,对着操作,后边有一个样本对应双端的表格
原始数据上传NCBI-转录组数据经常碰到老师在文章接收过程中,编辑要求将原始数据上传NCBI,要是没有数据上传经验的不要慌,小编手把手教你如何快速上传数据至NCBI (一)NCBI账号:上传数据必须有自己的...
蓝色至少写一列,并且至少一列名称需要不一样,艳样本名没有问题
原始数据上传NCBI-转录组数据经常碰到老师在文章接收过程中,编辑要求将原始数据上传NCBI,要是没有数据上传经验的不要慌,小编手把手教你如何快速上传数据至NCBI (一)NCBI账号:上传数据必须有自己的...
最近在尝试GCC的安装,尝试了好几次都以失败告终,深感生信系统环境问题的重要性,总想用一篇牢骚文章来表达自己的感触。偶然间,某郑同学,一语点破天才小编的感触: 生信分析中,最...
官网有解释的
线粒体组装软件Mitofinder安装与使用下载与安装如下,官网https://github.com/RemiAllio/MitoFinder[https://github.com/RemiAllio/MitoFind...
CNCB(China National Center for Bioinformation,国家生物信息中心),对标的NCBI,对国内研究者来说,数据上传跟下载方便的多,现在...
下载NCBI数据,使用ascp命令是最快的,但是小编之前尝试用该命令下载SRA数据,查阅了百度上的各种参数,最后还是没有成功,可能是有个“墙”存在的原因,小编后来有一段时间使...