本科毕业于浙江大学，硕士毕业于复旦大学，浙大读博ing。<br>如果没有及时回复可以发送邮件：jlyq617@gmail.com
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这几种标准化方式哪一种最好呢
使用deeptools将bam文件转换为bw文件
整理ChIP-seq / CUT & Tag 分析时用到的工具。本文只对使用的工具用法进行简单介绍。 deeptools 提供两个bam转换为bw的命令，分别是bamCove...
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得到差异peak后怎么知道与相关基因联系起来呢，是将这些差异peak进行注释吗
第9篇：差异peaks分析——DiffBind
学习目标 学习用DiffBind流程评估两个样本间的差异结合区域 用PCA评估样本间的关系 评估不同工具得到的差异peaks的一致性 评估差异peaks富集的工具 ATAC-...
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@geneonto 那如果是双端测序，是不是一个样本要写两行
原始数据上传NCBI-转录组数据
经常碰到老师在文章接收过程中，编辑要求将原始数据上传NCBI，要是没有数据上传经验的不要慌，小编手把手教你如何快速上传数据至NCBI （一）NCBI账号：上传数据必须有自己的...
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题主你好，我在填写样本信息表的时候一直出现error,我填写的如下
GV_WT1
GV_WT2
GV_WT3
GV_WT4
MII_WT1
MII_WT2
MII_WT3
MII_WT4
GV_CKO1
GV_CKO2
GV_CKO3
GV_CKO4
MII_CKO1
MII_CKO2
MII_CKO3
MII_CKO4
请问是哪里有问题，我应该如何修改呢原始数据上传NCBI-转录组数据
经常碰到老师在文章接收过程中，编辑要求将原始数据上传NCBI，要是没有数据上传经验的不要慌，小编手把手教你如何快速上传数据至NCBI （一）NCBI账号：上传数据必须有自己的...
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原始数据上传NCBI-转录组数据经常碰到老师在文章接收过程中，编辑要求将原始数据上传NCBI，要是没有数据上传经验的不要慌，小编手把手教你如何快速上传数据至NCBI （一）NCBI账号：上传数据必须有自己的...
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生信阿拉丁，为实用而生
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题主你好，我看文献中mouse fibroblasts做了GelCut和没有GelCut的smart-seq3，为什么这两种情况下barcode不同，只是为了区分这两种情况吗
你要的单细胞全长转录本建库方案：smart-seq3来了
作者：尧小飞审稿：童蒙编辑：amethyst 01 背景介绍 目前在NGS的科技服务市场上单细胞转录组和三代是最火的两个方向，也是由于工业技术升级带来的研究的新方向和新视野（...
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老师您好，如果有生物学重复，代码应该怎么写呢
使用Trinity进行转录组组装
Trinity是Broad Institute和Hebrew University of Jerusalem开发的RNA-Seq数据 转录组组装工具，包括三个模块， Inch...
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@鹿无为 我也没有找到，可以分享一下链接吗
从spike-in矫正到DESeq2的原理
写在前面的废话 最近在处理一批RNA-seq的数据，里面混入了spike-in。利用spike-in矫正之后，样本A的基因表达量普遍比样本B的基因表达量高3-5倍，这和我所熟...
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作者可以发一下这篇文章的链接吗
RNA-seq的十年（下）
前言 这一部分的内容主要涉及单细胞测序，空间转录组，新生RNA测序，翻译组，RNA-RNA之间相互作用，RNA-蛋白质相互作用以及未来展望。 常规RNA-seq进阶 源于整块...
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RNA-seq的十年（下）
前言 这一部分的内容主要涉及单细胞测序，空间转录组，新生RNA测序，翻译组，RNA-RNA之间相互作用，RNA-蛋白质相互作用以及未来展望。 常规RNA-seq进阶 源于整块...
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请问用的R是哪个版本，我安装xtail一直显示installation of package ‘/home/data/vip55/software/xtail_1.1.5-source.tar.gz’ had non-zero exit status
安装R包DESeq2和xtail
安装R包DESeq2和xtail 安装网址：https://github.com/xryanglab/xtail/blob/master/INSTALL 安装DESeq2 寻...
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@鹿无为 @鹿无为 我在想非链特异性建库应该无法区分正负链吧，只能是链特异性建库才行
链特异性建库如何区分正负链？
写在前面的废话 经过这两周意外的断更，我明白了一个道理，人都是具有惯性的…… 两周没写公众号，我似乎都习惯了懒惰，文章不想更了，笔记也懒得记了。 但是我没忍住双十一的诱惑，一...
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生信坑底躺着不动的男人<br>简书不常在，有问题可私信
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@鹿无为 为什么我找不到score列
链特异性建库如何区分正负链？
写在前面的废话 经过这两周意外的断更，我明白了一个道理，人都是具有惯性的…… 两周没写公众号，我似乎都习惯了懒惰，文章不想更了，笔记也懒得记了。 但是我没忍住双十一的诱惑，一...
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如果不是链特异性测序也是这样来提取吗
链特异性建库如何区分正负链？
写在前面的废话 经过这两周意外的断更，我明白了一个道理，人都是具有惯性的…… 两周没写公众号，我似乎都习惯了懒惰，文章不想更了，笔记也懒得记了。 但是我没忍住双十一的诱惑，一...
