写在前面 前天,我写了一个 TBtools 插件,意在让所有人都能自主分析转录组测序数据,进而获得 基因表达量矩阵(TPM) 和 基因读段计数矩阵(Count)。已经提过了,...
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mRNA-seq上中游分析需要用到Linux系统的terminal! 尽管TCGA数据库中已经提供了大量的处理好的表达矩阵数据,但是无论是自身实验需要,还是从NCBI的GEO...
今天跟大家分享的工具可以是用来处理带有分子标签(Unique Molecular Identifiers,UMIs)和细胞条形码(cell barcode)的数据。目前来说,...
单细胞填坑快2年了,虽说经常遇到一些薅头发的时候,但却总是割舍不掉。嗨,打啥感情牌呀,进入主题。在单细胞转录组分析中,目前使用的最广的软件是基于R的Seurat,具体安装方式...
TCGA数据库中含有的癌症名称,简写和中文名称。 Cohort英文名称中文名称ACCAdrenocortical carcinoma肾上腺皮质癌BLCABladder Uro...
step1-Load Data and Quality Control 一、数据下载和读入 数据下载和读入,有与下载很慢,直接导入下载好的数据。 (1)提取表达矩阵 (2)提...