整理ChIP-seq / CUT & Tag 分析时用到的工具。本文只对使用的工具用法进行简单介绍。 deeptools 提供两个bam转换为bw的命令，分别是bamCove...
IP属地：福建
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使用deeptools将bam文件转换为bw文件 -
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2021-05-23 ChIP-seq数据从头到尾比对及分析汇总（个人分析记录贴）0_1 前言 有时间再详细写introduction。先把我分析数据的流程记录下来，后续持续更新。 0_2 用到的软件或脚本 测序数据质控：fastp[https://git...
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专注WGBS Chipseq等数据分析<br>perl python R脚本编辑处理数据
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技术介绍 | 挖掘 TFBS 的利器——DAP-SeqDAP-seq技术自Cell论文发表后，飞速发展。目前已是ChIP-seq的替补选手。焦元小朋友分享了他的学习心得，与大伙共同学习。 CJ-陈程杰 转录因子是能够特异性地与...
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DAP-seq workflow
环境及软件 fastp、bowtie2、samtools、chipseeker 都是需要在服务器上安装的软件。fastp version 0.23.4 Bowtie 2 ve...
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m6anet_pipeline
1. 环境准备 1.1. 创建独立的工作目录 -目的：为了将m6Anet分析的所有相关文件集中管理，避免与其他项目混淆。-操作mkdir ~/m6anet_projectcd...
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