在umi框架中，图片等静态资源主要放到三个地方：1.在/pulbic目录下，一般放共享资源。2.在/src/assets/目录下，一般放全局静态资源。3.在/src/page...
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在umi中如何访问静态资源
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如何将多个生存分析曲线图片进行合并拼图survminer包的ggsurvplot()函数可以画好看的生存分析曲线，也可以用分面的方法分面绘制多组图片（教程可以见我以前给生信助手上的一个小建议「凌云34」Multi...
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生存模型的time C-index 计算与绘图0.Time C-index C-index 是一致性指数，与AUC值一样是评价模型预测能力的指标，在预后模型里，time-ROC很常见，Time C-index却不咋常见，...
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如何用R语言做差异代谢物的kegg富集分析编写：王采荷 感觉已经很久没有在简书上分享自己的东西了，今天在集合其他大佬的力量终于把“如何用R语言做差异代谢物的kegg富集分析”这个问题给解决了。我决定将这个过程分享到简...
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「r<-包」使用 sigminer 进行突变模式分析突变模式分析（Mutational Signature Analysis）已经逐步成为变异检测后一个通用分析，这篇文章简单介绍如何使用 sigminer 进行突变模式分析，以...
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COSMIC数据库介绍——癌症研究者必看这是Sanger 研究所 2018 年 发表的在《Nucleic Acids Research》上的关于COSMIC v86 新版本的一篇文章，对 COSMIC 数据库功能和...
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参考基因组中的chr*_random和chrUn_*序列如何处理？
在下载人和小鼠基因组做为参考时，大多数可能只留意到了chr1-22，chrY，chrX和chrM的参考基因组序列，于是分别下载了25条染色体序列，合并成一个fasta文件，用...
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【生信】EDirect的安装和使用
上次写过一篇批量下载基因组的文章，使用的方法是从NCBI一个网站上搜索，下载文件里提取ftp网址，然后再用wget批量下载的。（传送门：【生信】利用shell批量下载NCBI...
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GATK4-Mutect2-FilterMutectCalls
最近在搭建大panel（528基因）Tumor-Normal样本分析的管线，用的是GATK4-Mutect2工具。 1.GATK4用到的数据库（b37） 2.Mutect2 ...
