关于OrthoFinder 的介绍、安装、使用等资料汇总。
发简信
IP属地：广东
-
-
-
2021-11-23集群安装R包GOstats安装R包GOstats，出现以下错误： ERROR: dependency ‘httr’ is not available for package ‘KEGGREST’ * ...
-
2021-08-04：GO富集网络可视化工具利用Cytoscape上的插件可以实现GO 分析的网络化，不过非模式植物会很麻烦：具体参考了简书的以下内容： Bingo(Cytoscape插件)GO功能富集分析 - 简书 ...
-
主要关注于脊椎动物适应性进化与比较基因组学研究<br>简书原账号：WhyDoWeAge
-
GO富集可视化：clusterProfiler+GOplot现在的社会正处于大数据时代，生物学研究领域也迎来了大组学时代。无论是植物。动物，还是微生物，都有许多物种被测序。在后续的个性化分析过程中，通常会得到庞大的基因数据，如何选择一...
-
喜欢深海鲸鱼的悲鸣，也热爱欢快的鸟语花香！<br>
-
-
2021-07-09：细数我在GO注释时遇到的那些报错
上回说到，我废了九牛二虎之力，终于拿到了百十来个GB的GO EVIDENCE 数据，你猜怎么着，接着往下进行的时候发现，R语言根本读不了。。。。心疼自己一秒钟 来吧，今天接着...
-
2021-07-04--GO富集之马铃薯的EVIDENCE不好搞
一连试了几天用集群的R构建EVIDENCE,结果并不能让我满意，基本上一天只能跑一个，再运行第二个的时候就会报错。尝试到现在就只剩下马铃薯的还未成功了，暂时先把问题撂在这，我...
-
2021-07-01
昨天忙着做实验，没时间鼓捣数据，今天也得做实验，不过在试验开始之前还是先整理一下吧： 首先是安装R包 尝试本地运行后发现，报错： 本地内存太小，程序无法运行。 到集群上运行，...
-
2021-06-29：Go注释的相关操作记录主要参考：(4条消息) 无参转录组GO、KEGG富集分析——diamond+idmapping+GOstats_ygyxl的博客-CSDN博客[https://blog.cs...
-
Linux集群中安装miniconda2主要参考：conda管理生信软件一文就够 (qq.com)[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzAxMDkxODM1Ng==&mid=224...
-
2021-06-28 Rstdio中DESeq2相关软件的安装
#首先升级R install.packages("installr") library(installr) updateR() library("BiocManager") ...
-
2021-06-27--致病疫霉的差异基因表达分析
在Rstdio软件里使用DESeq2进行致病疫霉及茄科植物的差异基因表达分析，茄科植物由于隶属不同物种，各个基因有所差异，故优先进行纵向比较，即比较接种不同时间点下同一植物的...
-
生物信息学<br>干细胞转化医学
-
简书太垃圾了，已经弃用，改用语雀
-
-
