计算reads的覆盖度经常使用samtools，但是pandepth的速度会更加快！ PanDepth安装非常简单 使用方法也很容易 -g; gff作为输入，可计算基因的深度...
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PanDepth快速计算reads深度，覆盖度
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我的生信之路--linux安装和基本配置计算机和人工智能的快速发展，加之新的测序技术的革新和成本的下降，生命科学和计算机科学的交融也越来越密切。谷歌的alphafold已经揭示了蛋白质的折叠密码，被称之为解...
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sam转bam文件报错
在做BWA比对到参考基因组后，得到sam文件，在进行sam转bam时候遇到一个报错： [W::sam_read1] parse error at line 1 [main_s...
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LASTZ说明文档（一）LASTZ说明文档(v1.04.15, Aug27 2021 build)本文参考自LASTZ发行版[http://www.bx.psu.edu/~rsharris/last...
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组装电脑基础知识之内存条
前言 本系列文章是为准备自己组装台式机的小伙伴写的关于中央处理器CPU、主板、显卡等部分的参考资料。 一、简介 内存条是CPU可通过总线寻址，并进行读写操作的电脑部件。 二、...
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找 illumina 接头序列1.https://support.illumina.com.cn/downloads/illumina-adapter-sequences-document-1000000...
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生信分析学习笔记 - RNAseq （四） trimmomatic声明：本文部分内容和部分图片来源于网络。本文为生信小白学习笔记，不能保证专业名词和内容全部正确或权威。 下图为某一条RNAseq从数据预处理，序列回帖到数据可视化的工作流程，...
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gffread软件使用教程gffread 不仅可以实现GTF与GFF的互相转换，而且还可以对GFF文件进行过滤处理。可以直接读取GTF文件。 相关database：最好在ucsc上下载。或者cellr...
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前沿综述 | 空间转录组学入门指南目前关于空间转录组学的许多文献是技术性的，并不面向不熟悉该领域的研究人员。近日，《Genome Medicine》发表了一篇综述文章为空间转录组学提供了一个入门指南：涵盖了生...
