1 Bedtools:一个强大的基因组算法工具集 Bedtools是由犹他大学昆兰实验室开发的基因组算法工具集,它堪称是基因组分析工具中的瑞士军刀。Bedtools可以对基因...
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本节继续介绍通过ggplot2来绘制环状条形图,重点使用annotate函数对数据进行注释 自定义颜色 构建数据 计算角度 构建分组线段 数据可视化
经常会遇到对文件的排序,这里记录一下如何先按照染色体号排序,然后按照坐标位置排序 这里,先按照第一列进行排序,然后第二列按照数字大小从小到大排序,其中1,1的意思是从第一列到...
写在前面 热图,或称热力图,是外文 Heatmap 的直译。在几乎所有数值分析相关工作中都可以看到。生物信息学数据,自然躲不过。无论是形态数据,还是基因拷贝数数据,或是基因表...
前言 我们知道,细胞间信息传递方式一个是细胞表面配受体的相互作用,另一个通过细胞产生的可溶性小分子,即细胞因子。在单细胞数据分析中下游,有时候我们想看某几种细胞类型之间的相互...
本期介绍一个控制热图颜色范围并规定指定值颜色的小技巧。 使用的是R语言的pheatmap包,先生成随机数据: data1如下: 查看数据范围: 使用上面的矩阵做热图,要求低值...
通常由于网络原因出现Cytoscape网站不能打开或者点击下载无反应的情况,着实让人烦躁。于是在打开网页源代码发现新大陆,点击进入https://cytoscape-bu...
"吴老大在Coursera上的Deeplearning课程,现在都采取免费试听一周,之后按照307刀/周收费,网站上怎么找不到免费旁听的渠道了?" 前言 Coursera(类...
数据筛选是在分析中最常用的步骤,如数据挖掘分析中,从TCGA或GEO得到的表达矩阵要不断筛选,来进行数据整理。match函数是生信技能树生信爆款入门课程[https://mp...