生信云笔记

日常瞎掰   这一波疫情的反弹给上海很多地方按下了“暂停键”，从干饭人变成 “饭人” ，也许只有一个通告的距离。一觉醒来，也许小区大门口就贴上了“封闭管理的告示”。本以为就像...

上校的猫

参考： [1]. Durand, N.C., et al., Juicer Provides a One-Click System for Analyzing Loop...

苏牧传媒

Bowtie的中文意思是：领结，蝴蝶结 Bowtie2是比对软件Bowtie的第二版本，主要改进了支持gap比对。 Bowtie2用户手册： http://bowtie-bi...

生信小书童

1 Bedtools:一个强大的基因组算法工具集 Bedtools是由犹他大学昆兰实验室开发的基因组算法工具集，它堪称是基因组分析工具中的瑞士军刀。Bedtools可以对基因...

R语言数据分析指南

本节继续介绍通过ggplot2来绘制环状条形图，重点使用annotate函数对数据进行注释 自定义颜色 构建数据 计算角度 构建分组线段 数据可视化

生信石头

写在前面 热图，或称热力图，是外文 Heatmap 的直译。在几乎所有数值分析相关工作中都可以看到。生物信息学数据，自然躲不过。无论是形态数据，还是基因拷贝数数据，或是基因表...

周运来就是我

前言 我们知道，细胞间信息传递方式一个是细胞表面配受体的相互作用，另一个通过细胞产生的可溶性小分子，即细胞因子。在单细胞数据分析中下游，有时候我们想看某几种细胞类型之间的相互...

生信杂谈

本期介绍一个控制热图颜色范围并规定指定值颜色的小技巧。 使用的是R语言的pheatmap包，先生成随机数据： data1如下： 查看数据范围： 使用上面的矩阵做热图，要求低值...