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R基础-08.任意基因任意癌症表达量分组的生存分析 参考视频【生信技能树】生信人应该这样学R语言代码为自己学习总结 由于工作上的一些事情，R基础学习断更快一周了，今天补起 1...

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对于非模式生物或者无参考基因组的项目，经常需要进行基因的功能注释，而GO注释是基因功能注释的重要部分。有很多软件能够获得GO注释的信息，例如interproscan、eggn...

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导读 利用富集分析，我们可以把很多看着杂乱的差异基因总结出一个比较整体反应事件发生的概述性的句子。 例如：TP53信号通路和胃癌的发生有关。而不是说BAX、BID、ABL1、...

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学习linux常用命令，并且实战ChIP-seq已经一个月了。现在需要用R包ChIPseeker进行注释，发现R已经忘了大半。补课R语言。。对peak的注释分为两个部分——结...

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这次和大家分享下利用ggmaplot绘制差异基因筛选后的火山图，用到的基因集是ggpubr里面自带的数据集diff_express数据集 可以看到basemean为所有样本数...

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事由起因 昨天，有个童鞋咨询如何使用蛋白ID进行功能富集分析，功能富集分析主要是KEGG和GO。 思路 蛋白ID转UniProt数据库ID UniProt数据库ID转KEGG...

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# rm(list=ls())#clear Global Environment# setwd('F:\\RStudio\\RStudio_workPath\\heatmap...

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（第二种方法安装qiime2）个人认为是最简单的。yml打不开，通过conda 命令安装 对网络有要求。 第一步，下载vitural 刚开始的时候，我下载的是最新的7.0.4...

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一、设置开发人员选项 修改之后需要重启 二、修改系统设置打开控制面板->程序与功能->启用或关闭windows功能勾选 [适用于linux的windows子系统] ...

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本文转自生信人https://www.shengxin.ren/article/16 1、简介 SRA（Sequence ReadArchive）数据库是用于存储二代测序的原...

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  作为生命科学的从事者，不论是老师或者学生都应该用过NCBI((National Center for Biotechnology Information Search d...

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R可视化相关性矩阵的几种方案 R中相关性矩阵的可视化解决方法在已经有很多了，我们在这里总结一些常用的都有哪些： ggplot2包 corrplot包 热图包(pheatmap...

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关于相关性，表示数据之间的相互依赖关系。但需要注意，数据具有相关性不一定意味着具有因果关系。 相关性在组学数据挖掘中应用非常广，如样本的重复检验、基因的共表达分析、微生物群落...

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1. Nature review：一文读懂细菌影响化疗的所有已有机制（必读） NAT REV GASTRO HEPA[IF:16.99]① 肠道菌群通过促进药效、清除和损害抗...