各位看官老爷们大家好，俗话说，万丈高楼平地起，今天就带大家学习下生物信息学习过程经常用到的最基础但也是最实用的一些linux命令，当你的小伙伴们还在使用鼠标点点点的时候，你只...
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常用的一些linux基础命令
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【生信实战】只会GO/KEGG，何不试试Reactome数据库进行富集分析REACTOME 是一个开源、放开、人工整理并经过同行评审的通路数据库。目标是为各个通路提供可视化、可解释的分析，以支持基础研究、临床研究、基因组分析、建模、系统生物学等。 ...
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使用wget下载GEO数据我们有时需要下载GEO数据，使用getGEO的话比较麻烦，特别是当我们只需要其中某一两个文件时。但是当我们直接复制文件链接，使用wget下载时，却只能下载当前的网页。 经过我...
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单细胞表达矩阵文件转换
先附上学习连接https://mp.weixin.qq.com/s/NaZ5kz3ew2O01cFEnK8sXg这个问题之前也遇到过，在此搬个小板凳来学习学习 数据下载 由于...
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TCGA / 组织来源编码 / Tissue Source Site Codes
Tissue Source Site Codes TSS CodeSource SiteStudy NameBCR01International Genomics Conso...
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多种方法实现基因ID SYMBOL 与 ENTREZID转换方法一 ID转换，ENTREZID是进行GO分析最好的ID类型（针对clusterProfiler）ID转换用到的是bitr()函数，但我的SYMBOL 转 ENTREZID...
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跟着Nature Metabolism学作图:R语言ggplot2热图组合树图和双层分组标记论文 Single-cell profiling of vascular endothelial cells reveals progressive organ-specif...
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TCGA数据库的利用（一）—— 数据下载！前序 还有1个多月就要毕业了，而在此之前需要顺利完成自己的毕设，因为对纯生物方向一点也不感兴趣，所以课题方向选的是生信—TCGA数据的利用，虽说本科专业与生物相关，但在整个大...
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Linux文本操作常用命令在Linux系统里常用于文本查看、操作、统计的命令： • head/tail，cat/tac，less/more• wc，sort，uniq• cut，paste 通过多敲键...
