1.构建样本信息矩阵 diffbind包，需要构建一个csv的文件矩阵，输入服务器中bam和narrow文件位置。 2.载入数据，处理数据 3.构建分组矩阵 4.统计结果总结...
发简信
IP属地：北京
-
2023-10-08 CUT&Tag数据差异peak分析
-
遗传学 博士研究生在读
-
软件17 —— DiffBind
一、 基本介绍 DiffBind是鉴定两个样本间差异结合位点的一个R包。主要用于peak数据集，包括对peaks的重叠和合并的处理，计算peaks重复间隔的测序reads数...
-
2021-05-23 ChIP-seq数据从头到尾比对及分析汇总（个人分析记录贴）0_1 前言 有时间再详细写introduction。先把我分析数据的流程记录下来，后续持续更新。 0_2 用到的软件或脚本 测序数据质控：fastp[https://git...
-
2023-09-27对CUT&Tag数据进行注释
主要参考这篇文章教程：https://www.jianshu.com/p/26aaba19a605[https://www.jianshu.com/p/26aaba19a60...
-
2023-09-26 CUT&Tag数据三个生物学重复取common peaksCUT&Tag数据随笔记录 1.要做一个H3K27ac与PR的互作分析热图。 1.1样本的合并以及取交集peak分别对每一个样本callpeak得到5w左右peak。如果将3...
-
北京大学生物信息学本博，做一些肿瘤多组学、质谱、三维基因组相关的东西，喜欢篮球，摄影
-
小王小王，垃圾大王<br>
-
生信 | ATAC-Seq基础分析+高级分析+多组学分析写在前面 其实很多作者已经探索的差不多了，相关脚本、教程也很多，但我还是自己系统的总结一下吧。有时候感觉是浪费时间，但是在写的时候能发现并学习到很多新的知识，不断记录反思，也...
-
个人博客: xuzhougeng.top (随缘访问)
