一般基因组文章都会有下面这种酷炫图,用来描述基因组的基因密度分布,转座子的密度分布,和其他物种或者多倍体的多套染色体间的共线性关系,以及其他各种你只要测序就能加上的信息,比如...

一般基因组文章都会有下面这种酷炫图,用来描述基因组的基因密度分布,转座子的密度分布,和其他物种或者多倍体的多套染色体间的共线性关系,以及其他各种你只要测序就能加上的信息,比如...
转载自 LAI: 评估基因组质量一个标准 基因组组装完成之后,就需要对最后的质量进行评估。我们希望得到的contig文件中,每个contig都能足够的长,能够有一个完整的基...
0.参考https://github.com/zhaotao1987/SynNet-Pipeline[https://github.com/zhaotao1987/SynNe...
前言 最近的推文将是一个大系列,目录就不放了,可能会有点多,主要涉及了基因注释,比较基因组学分析,基因家族分析等,大家看我博客的顺序就行。 基因注释参考链接[https://...
目前热门的单体型基因组组装,以下内容来源于安诺的单体型基因组组装新品发布会单体型也称为单倍型。二倍体有两套染色体单体,一套来自父本,一套来自母本。在父本和母本之间会存在一些差...
Rfam是用来鉴定非编码RNA的数据库,常用于注释新的核酸序列或基因组序列。 最新版本的Rfam14.4,已经包含了3941个家族。 Rfam官方网址:https://rfa...
1. ncRNA 非编码RNA(Non-coding RNA, ncRNA) 包括rRNA,tRNA,snRNA,snoRNA 和microRNA 等不编码蛋白质的RNA,它...
我使用的maker版本为3.01.04 第一轮:将已知基因比对到基因组 包括两个部分:🔸屏蔽重复序列🔸将已知的转录组/蛋白序列与基因组进行比对 1.(可选)构建自定义重复序列...
GeneMarkGeorgia Institute of Technology开发的一系列基因预测工具。真核生物基因组预测主要会用到GeneMark-ES/ET, 其中Gen...