画图时经常遇到不同组的数据大小相差很大，大数据就会掩盖小数据的变化规律，这时候可以对Y轴进行截断，从而可以在不同层面（大数据和小数据层面）全面反映数据变化情况，如下图所示。 ...
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基于R语言绘制坐标轴截断图 -
ggplot2图例调成一列，终于找到了解决办法
有时图例较多，用ggplot2画图时候会出现图例占据图的半壁江山，想让图例排成一列，解决方法如下： guides(fill = guide_legend( ncol = 1,...
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你考虑过computeMatrix的工作原理么?写在前面的话 你既然点进来了，说明你多半用过这个软件。但我猜，大多数人早期使用这个软件的时候，一定是赶鸭子上架：因为要画图，所以必须会。 但你真的懂了么？ 太长不看系列 对于...
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【ChIP-seq 实战】一、数据分析流程组学分析之ChIP-Seq，蛋白质修饰。这里是佳奥，我们进入新一篇章的学习！ 首先根据生信技能树的课程思维导图简要列出实战分析的流程： sra-tools：下载测序数据 fa...
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【ChIP-seq 实战】二、软件安装和公共数据下载这里是佳奥！ 到了数据下载这一步，之前我都是在NCBI上直接用浏览器下载，不过有的数据寻找链接比较耗时，这一次开始我就使用sratoolkit来下载处理原始数据。 1 软件安...
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pheatmap行标签顺序大调整在科学论文中，我们经常要用到热图。我们在热图在单细胞数据分析中的应用比较系统地介绍了热图的一般规则。但是在实际操作中还是会遇到一些细节问题，如标签顺序。 我们知道一个好的热图...
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RSS指数及regulon细胞类型特异性RSS特异性指数 继前一篇帖子[网络CSI评估基因关联性及regulon聚类模块化[https://mp.weixin.qq.com/s/p5c0ZcjmqCfLEUNP...
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pyscenic | 单细胞转录因子分析，原理图文详解pyscenic做为scenic的python版本，相比R版本实现了分析速度上的巨大提升，尤其是最耗时的共表达网络构建步骤。实测时间如下，数据集1 (4257 cell x ...
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单细胞 | pySCENIC·转录因子分析（一）SCENIC (Single-Cell rRegulatory Network Inference and Clustering）是一种能够从单细胞 RNA-seq 数据（S...
