中山大学中山医学院-基础医学博士在读<br>欢迎关注个人公众号<br><br>公众号：bioinfomics<br>博客：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fdongwei1220.github.io%2F" target="_blank">https://dongwei1220.github.io/</a><br>
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AgRenSeq一种不依赖参考基因组且能快速克隆R基因的GWAS方法个人总结：GWAS是复杂性状相关基因定位的常用手段，其结果与参考基因组的选择有关，若多样性群体中的候选基因不存在于参考基因组，则无法鉴定。而Kmer-based GWAS则不...
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单倍型分析一、什么是单倍型？ 在单倍型分析前，首先需要明白什么是单倍型、什么是基因单倍型？ 一般来讲，所谓的单倍型是指同一染色体上不同变异位点的各种线性组合形式。那么基因单倍型自然就是...
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你好我想问下AGPv2的数据是在哪里下载的？
如何使用snpEff创建本地数据库
snpEff的使用是在Linux系统中Java运行环境下。 一、下载snpEff 方法一： 直接在家目录下载使用命令 wgethttp://sourceforge.net/p...
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BSA-Seq本文内容主要来自徐云碧老师2016年发表在PBJ上的综述“Bulked sample analysis in genetics, genomics and crop impr...
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CAU 徐明良教授 玉米抗病分子育种相关工作本文内容来自徐明良教授报告，仅供学习。 玉米基因组蕴含丰富抗病基因 与禾谷类其它作物，如水稻、小麦等不同，玉米是典型异花授粉作物，遗传基础复杂，基因组多样性明显，在长期进化过...
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Linux安装R包ggalt遇见的proj4报错
近来在利用R包ggalt以美化pca和pcoa图的展示，在linux环境下安装ggalt时，遇见proj4的报错信息如下： configure: error: libproj...
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一个标题行😭
GEO数据挖掘之第一步：数据预处理与差异分析
作为一个刚接触生物信息这个专业小白，我正在努力学习着最基础的东西，最先是了解GEO数据库，自己利用数据进行分析，还好之前有R语言基础，这第一步就花了很长时间，但是完成后是很有...
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请问我下载的series_matrix文件最后导入转换只有第一行，数据导入有什么方法吗？谢谢
GEO数据挖掘之第一步：数据预处理与差异分析
作为一个刚接触生物信息这个专业小白，我正在努力学习着最基础的东西，最先是了解GEO数据库，自己利用数据进行分析，还好之前有R语言基础，这第一步就花了很长时间，但是完成后是很有...
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学习记录1：同线性(Synteny)和共线性(Collinearity)文章仅是记录自己的学习使用，有错误请指出，我立刻改正！ 更多参考：https://shengxin.ren/question/541[https://shengxin.ren...
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启动子研究方法高质量总结原文链接：https://zhuanlan.zhihu.com/p/401460339 (伯远生物) 01 启动子的基本类型 启动子是基因的重要组成部分，其主要功能为调控基...
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启动子作用功能以及分类介绍
启动子（promoter） 作用和功能：启动子是指一段能使特定基因进行转录的DNA序列。启动子可以被RNA聚合酶辨认，并开始转录合成RNA。在RNA合成中，启动子可以和调控基...
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答读者问(8)：如何批量查询marker基因(对应的蛋白)会不会在膜上表达？做实验的朋友们对这个问题应该是很感兴趣的，因为涉及到后续能不能实验验证。 一般的做法是拿基因名或者蛋白名去查文献，查网站。我知道的：uniprot、PDB、the human...
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全基因组关联分析学习资料（GWAS tutorial）20210313更新版
时隔一年多，于今日（20210313）再次更新教程，后续如果新出教程的话会一直更新。 同时感谢多年陪伴我成长、一直默默关注我的「你们」~ by 「橙子牛奶糖（陈文燕）」 1....
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Fine mapping定位QTL作物遗传育种需要发掘对农艺性状有重要贡献的QTL。某一重要农艺性状往往是由多个QTL调控。对这些QTL进行精细定位找出对应的基因对作物的改良具有重要意义。本文对如何进行...
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作图群体及作图方法作图群体 在学习数量遗传学课程时，经常碰到诸如DH群体等名词，还是需要把相关的专业名词积累一下。作图群体概念及分类介绍 - 简书 (jianshu.com)[https:...
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作图群体概念及分类介绍这是很多年前做的关于作图群体的PPT，懒得再排版了，直接截图上传了，需要PPT的可以私信小编。在介绍作图群体前我们先看一下之类性状和数量性状的差别： 当然还要知道几个基本的概...
