理论部分 该部分参考及引用陈连福的生信讲义，zhaofei的https://vip.biotrainee.com/d/103--。 由于仪器测序读长的限制等，在建库时会将DN...
IP属地：北京
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基因组De novo组装和 ALLPATHS-LG使用 -
gatk-4.1.9.0/gatk VariantFiltration warnings
15:55:13.094 WARN JexlEngine - ![0,14]: 'ReadPosRankSum < -8.0;' undefined variable Re...
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@蒂姆小山 可以，重要的是混池的突变体表型准确。
水稻BSA之利用Mutmap快速进行基因定位
许多重要的农艺性状为数量性状，由多个基因位点控制。利用传统的分子标记技术进行基因定位，常常需要花费较长的时间和大量的人力物力。2012年日本岩手大学（Iwate univer...
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R语言手动计算Tajima's D 和 Fst原理和公式参考： https://www.jianshu.com/p/c7ba1aa543fe[https://www.jianshu.com/p/c7ba1aa543fe]...
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R ggplot2绘制堆叠柱状图STEP1：了解数据特征 STEP2：整理数据（变成长数据） STEP3：画图 STEP3.1：基本图形 STEP3.2：改颜色 STEP3.3：改标签 STEP3.4：数值...
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统计fastq文件read长度及read平均长度
转录组分析使用stringtie定量后，如果使用DESeq2进行下游分析，需要使用prepDE.py生成read counts矩阵，prepDE.py需要fastq文件的re...
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修改stringtie、ballgown 结果中部分gene_id为ref_gene_id
问题：stringtie组装转录本后会改变原本参考基因组注释文件中的gene_id stringtie 组装、merge的stringtie_merged.gtf注释文件中的...
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MSKCC Research Associate<br>别赶不上野心，又辜负了努力
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多行命令并行管理，只需要一个脚本在上游分析中，多个样本常常要同时分析，为了节省时间我们常常会通过写一个简单的脚本去运行。 比如对于这样的一个accessionlist，样本数较少 我们先写一个比对的脚本 重...
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TaWRKY19 抑制TaNOX10表达，降低ROS反应，降低小麦条锈病抗性One-sentence summary:TaWRKY19 transcriptionally represses the expression ofTaNOX10, imp...
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