clusterProfiler 是业界大神Y叔写的一个R包,可以用来做各种富集分析,如GO、KEGG、DO(Disease Ontology analysis)、Reacto...
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1.安装 2.操作一个简单的Excel文档 操作注释及代码: 操作完成后,数据存储结果如下: 3. 操作简单Excel文档并添加数据格式 操作代码如下:附带数据格式的定义...
PCR引物设计应该算是生物实验基本技能吧,工具也非常多。Primer-BLAST、Primer Premier 都是比较经典的软件,除此之外还有很多新的在线设计软件,也很方便...
1. BAMStats BAMStats是一款从BAM文件中计算覆盖度和其他数据,并生成这些数据的描述性统计的工具 1.1 安装 1.2 使用 java -jar BAMSt...
寻找trio家系新发突变位点 http://wintervar.wglab.org/错义突变评估网站突变reads占总reads的比例,看父母结果,辅助判断。在/home/D...
这个步骤推荐在R里面做,载入表达矩阵,然后设置好分组信息,统一用DEseq2进行差异分析,当然也可以走走edgeR或者limma的voom流程。基本任务是得到差异分析结果,进...
在进行测序数据下游分析的时候常常需要用到不同的数据库,而这些数据库的分析的输入文件经常是各有区别,因此我们常常需要将各类ID(ensamble ID、Entrez ID、ge...