哈哈,从技能树追过来
R语言GEO数据挖掘:步骤三:进行基因差异分析进行基因差异分析 1.读取数据 2.检测数据 3.为每个数据集绘制箱形图,比较数据集中的数据分布(单一某个基因分析) 4.对某种基因在样本中的表达情况根据分组统一分析(所有基...
xiexie
R语言_seq()函数用法前言:微博参与话题 #给你四年时间你也学不会生信#———— 导师赠与之醒世名言 Sequence Generation:生成规律的序列。seq是一个带有默认方法的标准通用...
0、R包安装 1、差异表达矩阵 2、基因差异分析(三选一就可以进行后续分析) 测序的数据,DESeq2 ,edgeR一般用的比较多,接受的是RNAseq的count数据,非l...
引言 我最近在做TCGA数据分析,在处理中遇到的问题及其收获。主要包括: case ID 大小写处理 数据的匹配 涉及到的函数有: 小写 tolower 大写 touppe...
春节后的第一次写学习笔记,还是要提醒大家没事别聚集、别聚集、别聚集!重要的事情说三遍! 前几天看到公众号里写了GSEA的文章,虽然我之前跟着很多网上的教程走过一遍GSEA分析...
测序数据下机分析需要在linux系统下处理,日后再学。
镜像设置 file.edit('~/.Rprofile')把下面代码加入配置文件中 查看 数据框操作R包 dplyr 此包为数据框的操作提供了许多便捷的操作install.p...
对于甲基化芯片的差异分析,除了有探针水平的差异分析,还有差异甲基化区域DMR分析。 差异甲基化区域的示意图如下: 该图片来自Bumphunter的文献,图中绿色矩形代表的就是...
照着星球的代码跑了下 with的使用要注意 数据结构 R语言编程艺术学习记录 第一章 绘图pdf 思考,如何返回所有奇数 理解画图 example() #实例函数使用exa...