0、R包安装 1、差异表达矩阵 2、基因差异分析(三选一就可以进行后续分析) 测序的数据，DESeq2 ，edgeR一般用的比较多，接受的是RNAseq的count数据，非l...
IP属地：黑龙江
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TCGA-数据整理（counts =》表达矩阵）
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R语言：TCGA数据分析一
引言 我最近在做TCGA数据分析，在处理中遇到的问题及其收获。主要包括： case ID 大小写处理 数据的匹配 涉及到的函数有： 小写 tolower 大写 touppe...
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GSEA学习笔记春节后的第一次写学习笔记，还是要提醒大家没事别聚集、别聚集、别聚集！重要的事情说三遍！ 前几天看到公众号里写了GSEA的文章，虽然我之前跟着很多网上的教程走过一遍GSEA分析...
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ChAMP 分析甲基化芯片数据-差异分析下篇
对于甲基化芯片的差异分析，除了有探针水平的差异分析，还有差异甲基化区域DMR分析。 差异甲基化区域的示意图如下： 该图片来自Bumphunter的文献，图中绿色矩形代表的就是...
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Day01 Markdown练习--王今日学习笔记 1.如何学习 讨论交流 简书记录学习笔记 2.如何解决学习中的问题 正确使用搜索引擎 正确提问 3.学习平台的构建 幕布
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Day1-学习平台-ZW一、学习小组的正确打开方式 1.如何学习 （1）电脑看教程 （4）完成后@花花 二、如何搭建高效的学习平台 幕布 代码引用 Hello world 多段代码引用 本地图片上传
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fasta和fastq格式文件的shell小练习-解答
fasta和fastq格式文件的shell小练习 原文链接 这个是有机结合生物信息学的linux和数据格式的练习题：下载bowtie2软件后拿到示例数据： 1)统计reads...
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生信人的linux考试20题
一、 在任意文件夹下面创建形如 1/2/3/4/5/6/7/8/9 格式的文件夹系列 这个题目考的mkdir -p的用法，详见Linux Day1: cd/pwd/mkdir...
