作者：ahworld链接：GPU版scanpy (rapids)实践 | 大型单细胞数据分析利器[https://mp.weixin.qq.com/s/H4IfeI6TdK7...
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GPU版scanpy (rapids)实践 | 大型单细胞数据分析利器 -
Python脚本：CDS序列翻译成蛋白质并计算分子量程序编写思路： 1.打开待翻译的文件并进行读操作。 2.将CDS序列变成列表后，三个元素合并为一个元素生成新的列表。 3.编写翻译模块，定义了两个函数——翻译和计算分子量。 ...
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单细胞分析——如何确定合适的分辨率（resolution）水滴石穿，非一日之功 本期内容同时发布于单细胞天地微信公众号。 在进行单细胞分析时，非常重要的一步就是聚类分群，而在这个过程当中经常令人困惑的是如何选择一个合适的分辨率（re...
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SJM HPC-SGE 投递任务管理工具简介
HPC-SGE环境下的任务投递方式 HPC指的是高可用计算集群，是相对于单机服务或节点而言的，通过节点或集群间的分布式结构解决任务需求中的高算力、高存储、强动态调节等功能...
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基于Seurat UAMP和celltype的RNA Velocity速率分析的全套流程参考资料：参考生物技能树[https://mp.weixin.qq.com/s/TJsdj7qesZGlvmEkNLAy0A]Velocyto官网Tutorial[https...
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一网打尽scRNA矩阵格式读取和转化(h5 h5ad loom)scRNA矩阵存储的文件格式有10X单细胞测序数据、h5、h5ad、loom：10X单细胞测序数据经过cellranger处理后会得到矩阵的三个文件：matrix.mtx...
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富集分析天花板之ClusterProfiler4说在前面 在国内做生信的小伙伴或多或少都听过一个大名鼎鼎的名字---Y叔，想当初小编初入生信大门时还专门百度查了一下，他就是南方医科大学生物信息学系主任余光创教授。Y叔在国际...
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SCTransform：单细胞样本的标准化Seurat从3.0版本引进了SCTransform这个函数用来对数据做标准化，并且这一个函数可以代替三个函数（NormalizeData, ScaleData, FindV...
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一个R包搞定22种单细胞基因差异分析参考文献：Confronting false discoveries in single-cell differential expression[https://doi.o...
