计算蛋白理化性质一般在网站，protparam[https://web.expasy.org/protparam/]此网站只可以一次输入一条序列，结果需要挨个复制。当序列条数...
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在ProtParam 批量预测蛋白序列理化性质参数
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vcf文件中短序列插入缺失（INDEL）标准化问题：INDEL在vcf文件中表示的非唯一特性 INDEL 在Wikipedia中的解释： Indel is a molecular biology term for an ...
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命令行中tassel的使用
tassel需要Java环境 downloads tassel_5 添加到环境变量中 命令行的tassel有很多的plugin，可以使用下面的命令查看包含了那些plugin ...
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深度学习中神经网络层，神经单元的设置，以及调参指导
在学习了吴恩达的课程以后，把吴老师讲解的调参方法用到实验中，感觉有了方向，节省了很多时间。写点笔记，记录一下实验心得。以下有部分是个人理解，有疑问的欢迎交流。 一，设置与调整...
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【R去重】 保留第一个重复/去所有的重复参考： R语言第二章数据处理③删除重复数据果子学生信 1.保留第一个重复: A,A,B,C --->A,B,C2.去掉所有重复:A,A,B,C --->B,C一般情况函数默认...
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选择blast比对第一条best hit的结果
blast的结果中每条contig都会有很多hit，最好不用max_target_hit这个参数，因为它输出的是数据库中top的序列而不一定是比对最好的序列，即使所有版本都包...
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玉米基因ID转换方法
在玉米的基因或基因组研究中常常需要用到基因ID转换的问题，这里我将用的方法介绍一下： 1. 部分ID新旧版本基因组的基因ID转换—网页版 ensembl网站的 ID Hist...
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【conda】网络错误CondaHTTPError: HTTP 000 CONNECTION FAILED for url <https://repo.anaconda.com/pkgs/mai...
（1）错误信息 （2）当前conda的channel信息 （3）配置conda镜像（清华、中科大都可以，但清华的不要用https） conda config --add ch...
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Dockerfile封装实战学习——python项目
今天项目需要将python项目封装成docker提供服务，参考同事的Docker封装代码一边巩固学习一边实战。首先熟悉一下docker的一些概念。然后用一个实例介绍Docke...
