主成分分析，不只需要找到几个虚拟但不知具体为何物的主成分因子，还需要知道我们提供的变量在各个主成分因子上的载荷（有正有负）和贡献度，以及具体保留多少个主成分因子才能既尽量保留...
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R语言~高级PCA分析 -
一篇数据挖掘文章的图表复现-10.文章 文章标题：Characterization of an endoplasmic reticulum stress‐related signature to eval...
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机器学习模型评价指标(分类)前阵子因为指标踩了很多坑,花了很多时间, 我想还是有必要总结一下, 梳理一下知识点啥的... 从classification开始说起. 只要在网上查一下分类模型评价指标, 基...
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TCGA甲基化数据下载以及相关临床信息整理之前的文章里已经按照教程进行了TCGA数据库的一些练习（RNA-seq、芯片、生存分析），现在学习TCGA甲基化数据的分析过程。 参考文章：1.甲基化的一些基础知识2.Mak...
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2021-03-26 一文教会你查找基因的启动子、UTR、TSS等区域以及预测转录因子结合位点来源：https://cloud.tencent.com/developer/article/1189476 基础知识 首先我们了解一些基础知识（注：文中图片皆可点击放大查看...
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甲基化套路和甲基化有关的。可以先了解下甲基化：450k甲基化基础450K甲基化芯片数据处理传送门450k甲基化芯片常用工具包：ChAMP和minfi等。 甲基化的一些预备知识甲基化程度...
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PheWAS(全表型组关联分析)----PheWAS的R包测试及分析(二)
由于上次写完教程一后还有许多疑问还没解决，在师兄的建议下看了一下R包中核心函数的源码(到底在做什么回归?)，大概解开了心中的部分疑惑。最近在看很多问题时候，总会有些急躁，反而...
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文献阅读：细胞异质性的表观遗传学基础这篇文献是今年的11月发表在Nature reviews上的一篇综述，题目是The epigenetic basis of cellular heterogeneity。主要...
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最健康的成长心态，是丧而不颓文/韩大爷的杂货铺 1. 话说有位学生，对自己要求很高，不光学习刻苦，成绩名列前茅，各方面综合素质也很好。 在他毕业前，班主任老师组织了一场全班测验。 测验结束后，当场批卷子...
