测序深度(Sequencing Depth) 相当于测了几遍； 指测序得到的总碱基数（bp）与所测物种基因组大小的比值，其是评价测序量的重要指标之一； 如：测序产生了1000...
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IP属地：上海
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名词解释：测序深度&RPKM、FKPM、TPM
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基础——illumina测序原理与细节（以RNA-seq为例）目前我们主要分析的数据还是二代测序的数据，也就是大家经常挂在嘴边的 NGS，而这其中最大的赢家应该算是 illumina 测序公司了，其经典的边合成边测序（sequencin...
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一文阐述链特异性测序——stranded? reverse-stranded? un-stranded?小小的眼睛里，装着……大大的疑惑 全文2800字，伤脑筋…… 今天尝试把自己对于 stranded、reverse-stranded、un-stranded 这个问题的理解给...
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R语言中的连接dplyr中的join系列与merge函数
在数据分析过程中，仅仅涉及一张表格的情况是非常少见的，我们经常需要联系到其它表格的数据，整合这些表格的信息。这时我们需要常见的三类操作来完成。 合并连接：根据观测合并表格 筛...
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R语言绘图包02--热图pheatmapR语言绘图包系列： R语言绘图包01--优秀的拼图包patchwork[https://www.jianshu.com/p/e57555d48c91] 热图输入的数据是数值型...
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R相关性分析和相关性热图相关性分析 相关性分析是指对两个或多个具备相关性的变量元素进行分析，从而衡量两个变量因素的相关密切程度。相关性分析旨在研究两个或两个以上随机变量之间相互依存关系的方向和密切程...
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蛋白质数据分析笔记MaxQuant后续分析perseus使用1官方给出了三个例子[http://coxdocs.org/doku.php?id=perseus:user:use_cases:start][http://coxdocs.o...
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2019-11-12 蛋白质组学数据中缺失值处理转发自http://crickcollege.com/news/170.html 有趣的小故事 美国作家Shel Silverstein有一篇经典的图画寓言---《缺失的一角...
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2019-11-12 人气推文p值、E值、FDR、q值…你晕菜了吗？续集来啦！转发自http://crickcollege.com/news/148.html 承前 小编很惊喜地看到，上一篇介绍蛋白质组学统计学参数的推文在朋友圈着实火了一把，真心感谢各...
